Eu farei análise de expressão diferencial de rnaseq no seu conjunto de dados

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Desenvolvedor de pipeline de bioinformática

Construo pipelines de bioinformática reprodutíveis para análise de dados de NGS, com especialização em expressão diferencial de RNA-seq e genômica de câncer. Projeto recente: pipeline de RNA-seq no c...
Sobre este Serviço

Você é um pesquisador ou cientista com dados de RNA-seq que precisa de uma análise profissional?


Eu vou analisar seu conjunto de dados de RNA-seq e identificar genes diferencialmente expressos usando DESeq2, entregando resultados prontos para publicação.


O QUE EU OFEREÇO:

- Alinhamento ao genoma de referência usando HISAT2

- Análise de expressão diferencial com DESeq2

- Gráfico de volcano e heatmap dos principais DEGs

- Relatório completo de análise em HTML

- Scripts limpos e documentados em R e Python

OS ENTREGÁVEIS INCLUEM:

- Resultados de expressão diferencial com DESeq2

- Análise de enriquecimento de processos biológicos GO

- Análise de vias do Reactome com vias clínicas

- Figuras prontas para publicação

- Relatório completo em HTML

MINHA EXPERIÊNCIA:

Construi um pipeline completo de RNA-seq analisando dados reais de genômica de câncer de mama do conjunto de dados NCBI PRJNA432903. Identifiquei 2298 DEGs significativos com PC1 explicando 86% da variância.


O QUE PRECISO DE VOCÊ:

- Arquivos FASTQ brutos ou matriz de contagem pré-processada

- Genoma de referência ou nome do organismo

- Condições experimentais e informações das amostras


FERRAMENTAS UTILIZADAS:

R, DESeq2, HISAT2, featureCounts, Python, Bash, Git, Linux, ggplot2, EnhancedVolcano


Faça seu pedido agora e receba resultados de bioinformática precisos e reprodutíveis entregues em

Especialidade:

Análise preditiva

Linguagem de programação:

Python

R

Frameworks:

Panda

Ferramentas:

caderno Jupyter

Colab

RStudio

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