Eu farei análise de expressão diferencial de rnaseq no seu conjunto de dados
Desenvolvedor de pipeline de bioinformática
Sobre este Serviço
Você é um pesquisador ou cientista com dados de RNA-seq que precisa de uma análise profissional?
Eu vou analisar seu conjunto de dados de RNA-seq e identificar genes diferencialmente expressos usando DESeq2, entregando resultados prontos para publicação.
O QUE EU OFEREÇO:
- Alinhamento ao genoma de referência usando HISAT2
- Análise de expressão diferencial com DESeq2
- Gráfico de volcano e heatmap dos principais DEGs
- Relatório completo de análise em HTML
- Scripts limpos e documentados em R e Python
OS ENTREGÁVEIS INCLUEM:
- Resultados de expressão diferencial com DESeq2
- Análise de enriquecimento de processos biológicos GO
- Análise de vias do Reactome com vias clínicas
- Figuras prontas para publicação
- Relatório completo em HTML
MINHA EXPERIÊNCIA:
Construi um pipeline completo de RNA-seq analisando dados reais de genômica de câncer de mama do conjunto de dados NCBI PRJNA432903. Identifiquei 2298 DEGs significativos com PC1 explicando 86% da variância.
O QUE PRECISO DE VOCÊ:
- Arquivos FASTQ brutos ou matriz de contagem pré-processada
- Genoma de referência ou nome do organismo
- Condições experimentais e informações das amostras
FERRAMENTAS UTILIZADAS:
R, DESeq2, HISAT2, featureCounts, Python, Bash, Git, Linux, ggplot2, EnhancedVolcano
Faça seu pedido agora e receba resultados de bioinformática precisos e reprodutíveis entregues em
Especialidade:
Análise preditiva
Linguagem de programação:
Python
•
R
Frameworks:
Panda
Ferramentas:
caderno Jupyter
•
Colab
•
RStudio

