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Vou analisar dados de sequenciamento genômico com ferramentas de bioinformática
Analiso dados genômicos usando bioinformática ou limpo seus dados do Excel
Oi, eu sou a Zoë, uma profissional de pesquisa especializada em Análise de Dados de NGS. Trabalho com dados genômicos e metagenômicos derivados de bactérias, vírus e animais. Uso ferramentas de bioinf...
Sobre este Serviço
Por favor, entre em contato comigo antes de fazer o pedido para que possamos confirmar o escopo do projeto, as opções de transferência de dados e as expectativas de entrega.
Ofereço análise de dados genômicos de WGS de procariotos adaptada às suas necessidades de pesquisa.
Com expertise em genômica e bioinformática, projeto e executo pipelines personalizados para fornecer resultados precisos e prontos para publicação.
Serviços que ofereço
- Controle de qualidade e pré-processamento de arquivos FASTQ
- Mapeamento de leituras para genomas de referência (WGS)
- Montagem de novo para projetos sem um genoma de referência adequado
- Chamada de variantes e anotação (SNPs, indels)
- Classificação metagenômica e perfil microbiano
- Genômica comparativa e geração de relatórios personalizados
Ferramentas e expertise
- Interface de linha de comando (CLI) para execução interativa e resolução de problemas de fluxos de trabalho de bioinformática
- Scripting em Bash para automação, pipelines reprodutíveis e processamento de alta capacidade
- Ambientes HPC para análise eficiente de genomas em grande escala: AWS
- Ferramentas de bioinformática: BWA, SAMtools, BCFtools, FastQC, Roary, Prokka, RAxML
- Bases de dados de referência: NCBI, GenBank, CARD, VFDB
O que você fornece:
- Dados brutos de sequenciamento (arquivos FASTQ, comprimidos se forem grandes)
- Genoma de referência
Tecnologia:
Python
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Outros
Perguntas frequentes
Tradução automática
Preciso entrar em contato com você antes de fazer o pedido?
Sim. Por favor, entre em contato primeiro para que possamos discutir os detalhes do seu projeto, opções de transferência de dados e expectativas de entrega.
Q: Como devo compartilhar meus arquivos FASTQ?
Arquivos FASTQ podem ser muito grandes, então recomendo usar um link de armazenamento na nuvem (Google Drive ou OneDrive). Por favor, compacte seus arquivos (.gz) antes de compartilhar para acelerar a transferência.
Qual é o tamanho máximo do dataset para o serviço?
Para que o processamento e o compartilhamento de arquivos ocorram sem problemas, o limite máximo de arquivo por pedido é de 30 GB.
