eu vou analisar resultados de knockout gênico virtual com sctenifoldknk

Eu analiso saídas existentes do scTenifoldKnk e organizo resultados de knockout virtual em torno do seu gene-alvo e tipo de célula.

O pacote Basic cobre um alvo e um tipo de célula usando seus arquivos de resposta ou de rede existentes. Verifico identificadores, resumo resultados de regulação diferencial e crio gráficos claros e tabelas editáveis. Comparações entre sementes fornecidas podem ser incluídas quando acordado antes da encomenda.

Você recebe tabelas de resultados, figuras, o script de análise e um README registrando as entradas e configurações. Uma revisão está incluída para a análise acordada.

Por favor, envie o seu gene-alvo, rótulos de tipo celular, arquivos de saída existentes e a pergunta que quer responder. Para enriquecimento, forneça os genes testados e a lista de genes de fundo.

Se você só tem um accession GEO ou um objeto Seurat, fale comigo primeiro: construção de rede e processamento de dados brutos precisam de um escopo separado. Eu utilizo codificação assistida por IA quando apropriado e verifico o código e as saídas. Comunicação escrita é bem-vinda.