Farei análise e visualização de dados de transcriptômica com r ou python

Eu ofereço análise de dados de transcriptômica, incluindo análise de expressão RNA-seq, testes estatísticos, visualizações (PCA, heatmaps, volcano plots) e modelagem básica de aprendizado de máquina para classificação e interpretação biológica usando R ou Python.

Inclui análise de transcriptômica:

• Processamento de dados RNA-seq (contagens / matriz de expressão)
• Análise de expressão diferencial (estatísticas básicas: t-test, comparações estilo DE se os dados forem fornecidos)
• Normalização de dados (escala básica / transformação log)
• Análise exploratória:
• Gráficos PCA
• Heatmaps
• Gráficos estilo volcano (se resultados de DE existirem)
• Comparação de grupos (controle vs doença, etc.)

Inclui análise estatística:

• Média, variância, fold-change
• Comparações de grupos (t-test / testes estatísticos básicos)
• Análise de correlação
• Interpretação básica dos resultados

Aprendizado de Máquina :

• Modelos básicos de classificação:
• Regressão logística
• Floresta aleatória
• Seleção de características
• Avaliação do modelo:
• Acurácia, matriz de confusão
• Curva ROC

Todos os pacotes incluem scripts de código reproduzíveis (R/Python) para que você possa reproduzir e validar totalmente a análise

Pedidos personalizados também são bem-vindos, com base em conjuntos de dados específicos, requisitos de análise e objetivos de pesquisa