Vou criar um caderno profissional de dinâmica molecular de ligantes de proteína

Procurando um caderno de dinâmica molecular (MD) cientificamente rigoroso para acelerar sua pesquisa? Eu forneço cadernos de MD de proteína-ligante prontos para uso, construídos com métodos padrão da indústria, cobrindo toda a cadeia desde arquivos brutos até análise pronta para publicação.

O que está incluído:

• Sistema Solvatado: Água TIP3P explícita com 0,15 M NaCl.
• Equilíbrio: Minimização de energia, protocolos NVT e NPT para um início estável.
• Trajetória de Produção: Formato DCD compatível com VMD, OVITO e PyMOL.
• Análise Abrangente: Uma figura de seis painéis (RMSD, RMSF, Rg, etc.) e logs completos de energia.
• Reprodutibilidade: Todos os parâmetros salvos em um arquivo de configuração com estruturas finais em PDB.

Padrões Científicos:

• Campos de Força: AMBER ff14SB (Proteína) & OpenFF Sage (Ligante).
• Cargas: Método quântico AM1-BCC.
• Dinâmica: Particle Mesh Ewald (PME) e integrador Langevin Middle (passo de 2 fs).

Cada caderno é citável e inclui referências completas da literatura. Envie-me sua ID PDB de Proteína e SMILES/SDF do Ligante antes de fazer o pedido para confirmar compatibilidade e prazos de entrega. Otimize seu fluxo de trabalho com uma ferramenta profissional projetada para excelência revisada por pares.