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Eu farei análise de expressão gênica diferencial de rnaseq usando edger ou deseq
Analista de Bioinformática e Redator Científico para Dados de RNA Seq e NGS
Sou estudante de MS em Bioinformática na NUST, com graduação em Optometria. Tenho experiência prática em análise de dados de sequenciamento de próxima geração (NGS). Minhas habilidades incluem análise...
Sobre este Serviço
Você está procurando uma análise profissional de expressão gênica diferencial de RNA-Seq?
Eu realizarei uma análise completa de DGE nos seus dados de matriz de contagem usando edgeR ou DESeq2 em R.
O que você vai receber:
- Controle de qualidade (gráfico PCA e heatmap)
- Detecção e remoção de outliers
- Normalização TMM
- Análise de expressão diferencial
- Gráfico volcano com genes significativos destacados
- Arquivo CSV com resultados completos
- Resumo dos genes upregulados e downregulados
Tenho experiência prática na análise de grandes conjuntos de dados de RNA-Seq com centenas de amostras usando pipelines edgeR e DESeq2 em R.
Por favor, envie uma mensagem antes de fazer o pedido para discutir seus dados e requisitos!
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Perguntas frequentes
Tradução automática
Em que formato meus dados devem estar?
Preciso de uma matriz de contagem bruta em formato .txt ou .csv e um arquivo de metadados com informações do grupo de amostras.
Qual ferramenta você usa, edgeR ou DESeq2?
Posso usar tanto edgeR quanto DESeq2, dependendo da sua preferência. Ambos fornecem resultados confiáveis para análise de DGE de RNA-Seq.
O que vou receber após a análise?
Você receberá figuras de alta resolução incluindo gráfico PCA, heatmap e gráfico volcano, um arquivo CSV com todos os resultados e um resumo dos genes diferencialmente expressos.
