Eu farei análise de seq de rna de célula única

Precisa de uma análise confiável, pronta para publicação, de seq de rna de célula única (scRNA-seq)? Eu executarei um pipeline completo e reprodutível que vai desde contagens brutas até figuras aptas para publicação.

Sou pesquisador de doutorado com publicações revisadas por pares em periódicos SCI Q3-Q4 e experiência prática com scRNA-seq da 10x Genomics em amostras humanas, de camundongo e de plantas. Cada projeto acompanha scripts em R ou Python com controle de versão, um parágrafo descrevendo os métodos e figuras que atendem às verificações de figuras de periódicos (300+ dpi, texto vetorial quando possível).

O que entrego, do começo ao fim:

- Controle de qualidade: filtragem de células/genes, detecção de duplos, filtragem mitocondrial/ribossomal, gráficos antes/depois do QC

- Normalização e integração: normalização com Seurat SCTransform ou Scanpy; Harmony, Seurat v5 ou Scanorama para múltiplas amostras / lotes

- Redução de dimensionalidade e agrupamento: PCA, UMAP/t-SNE, ajuste de resolução com clustree

- Anotação de tipos celulares: baseada em marcadores, além de mapeamento de referência com SingleR, Azimuth ou CellTypist; anotação de plantas via PlantPhoneDB ou scPlantLLM

- Expressão diferencial: marcadores de cluster e condição vs condição, com volcano / MA / heatmap / dotplot

- Análises avançadas (Padrão & Premium): inferência de trajetórias