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Vou analisar dados de rnaseq desde leituras brutas até enriquecimento funcional
Bioinformata e Pesquisador de Doutorado
Oi! Tenho mestrado em Bioinformática e atualmente sou estudante de doutorado e pesquisador dedicado à genômica e biologia molecular. Tenho ampla experiência em manipular dados biológicos em grande esc...
Sobre este Serviço
Bem-vindo ao meu Gig de Bioinformática & RNA-Seq!
Precisa de uma análise rigorosa, pronta para publicação, para seus dados de RNA-Seq da Illumina? Como mestre em Bioinformática e estudante de doutorado, ofereço processamento completo, personalizado para sua pesquisa. Transformo arquivos FASTQ brutos ou matrizes de contagem em resultados claros e reprodutíveis.
O que eu ofereço:
- Controle de Qualidade: FastQC e trimming de leituras.
- Alinhamento: Mapeamento preciso ao genoma de referência.
- Expressão Diferencial (DEGs): Análise estatística usando DESeq2.
- Enriquecimento Funcional: Caminhos GO e KEGG via clusterProfiler.
- Gráficos Prontos para Publicação: Heatmaps de alta resolução, Volcano Plots, PCA e redes.
Ferramentas: R, Python e pacotes do Bioconductor.
⭐ Por que me escolher?
- Rigor Acadêmico: Pesquisador ativo desenvolvendo pipelines confiáveis.
- Reprodutibilidade: Scripts limpos prontos para sua seção de métodos.
- Foco Biológico: Dedicado à sua questão de pesquisa específica.
️ IMPORTANTE: Por favor, envie uma mensagem ANTES de fazer seu pedido! Precisamos discutir seu desenho experimental e tamanho da amostra para garantir a melhor oferta personalizada. Vamos publicar seu artigo!
Perguntas frequentes
Tradução automática
Que tipo de arquivos preciso fornecer para iniciar o pedido?
Depende do pacote que você escolher. Para o pacote Básico, preciso das suas leituras de sequenciamento brutas (arquivos FASTQ). Para os pacotes Padrão e Premium, se você já realizou o alinhamento, pode fornecer a matriz de contagem bruta (.csv, .tsv ou .txt).
Quantas amostras estão incluídas no preço base?
Os preços base de todos os pacotes cobrem uma análise de até 6 amostras (por exemplo, 3 amostras controle vs. 3 amostras tratamento). Se seu desenho experimental incluir mais amostras, envie uma mensagem para uma oferta personalizada, pois o tempo de processamento aumentará.
Você pode analisar dados de organismos não-modelo?
Sim! Desde que exista um genoma de referência anotado e um arquivo GTF/GFF disponível em bancos de dados públicos (como NCBI ou Ensembl), posso realizar a análise. Por favor, entre em contato antes de fazer o pedido para verificar a disponibilidade do genoma de referência para seu organismo.
Vou receber os scripts usados na minha análise?
Sim! Se você selecionar o pacote Premium, fornecerei os scripts limpos e bem comentados em R ou Python usados para gerar seus resultados. Isso garante total transparência e reprodutibilidade, facilitando a escrita da sua seção de metodologia.
E se eu precisar de um gráfico muito específico ou altamente personalizado para meu artigo?
Os pacotes Padrão e Premium já incluem gráficos de alta qualidade e padrão (como PCA, Volcano Plots e Heatmaps padrão). No entanto, se precisar de uma figura altamente específica ou personalizada (como redes de interação complexas ou temas personalizados específicos), você pode adicionar a opção "Gráfico Personalizado Extra".
Como envio meus arquivos de dados grandes (FASTQ)?
O Fiverr possui um limite de tamanho de arquivo para uploads diretos. Para arquivos de sequenciamento grandes, você pode compartilhar um link seguro via Google Drive, Dropbox, OneDrive ou diretamente de servidores/bancos de dados de sequenciamento (como SRA/ENA), e eu farei o download de forma segura.
