Vou realizar docking e simulações de dinâmica molecular

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Usman Shahid
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Sobre este Serviço

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Oi Fiverr, aqui é o Usman. Sou um biólogo computacional que trabalha com descoberta de drogas, inibição de proteínas e muitos outros domínios. Ajudei estudantes de PhD e MPhil a concluírem suas pesquisas.

  1. Docking Starter: Docking de 1-2 ligantes com a proteína alvo + visualização de afinidade de ligação e pose. Análise de ADMET.
  2. Binding Insight: De 5 a 10 ligantes, análise de interação, mapeamento do sítio de ligação e pontuações de docking comparativas. Análise de ADMET.
  3. Dynamic Discovery Suite: Docking completo + simulações de MD (de 10 a 100 ns) com gráficos de RMSD, RMSF, Rg e estabilidade de ligação. (Converse se precisar de mais tempo de simulação.)
  4. Mais serviços também estão disponíveis para tornar sua pesquisa mais impactante, como MMPBSA, MMGBSA, análise de H-bond, etc.
  5. Se quiser discutir algum projeto de pesquisa, também estou disponível.

  • Ferramenta

    • Python

  • Tipo de gráfico

    • Comparação
    • Distribuição
    • Padrões

Conheça mais sobre Usman Shahid

Usman Shahid

molecular docking, Molecular dynamic simulations

  • A partir dePaquistão
  • Membro desdedez. de 2022
  • Responde em aprox.:1 hora

  • Idiomas

    Inglês
I am a computational biology researcher specializing in structure-based drug discovery and molecular docking. I use AutoDock Vina and PyMOL to perform end-to-end virtual screening pipelines — from target protein preparation to ligand docking, interaction analysis, and drug-likeness evaluation using Lipinski and Veber filters. What you get: Target protein preparation from PDB Molecular docking using AutoDock Vina Virtual screening of compound libraries ADMET & drug-likeness evaluation 10-100ns simulations in AMBER Clean report with results and binding scores.

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