Vou fazer modelagem por homologia, docking molecular e simulações de MD

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Bioinformática Estrutural

Estudante de doutorado especializado em Bioinformática Estrutural e descoberta de drogas baseada em IA. Posso fornecer soluções de pesquisa prontas para publicação usando protocolos padrão da indústri...
Sobre este Serviço

Acelere sua pesquisa com serviços profissionais de descoberta de drogas computacional. Como estudante de doutorado em Bioinformática Estrutural, ofereço simulações rigorosas, prontas para publicação, e análises personalizadas para seus alvos biológicos específicos.

O que eu ofereço:

  1. Consulta: Discussão sobre possíveis rotas para resolver tarefas.
  2. Metodologia detalhada: Detalhes de entradas, métodos e ferramentas.
  3. Modelagem por homologia: Predição de estrutura 3D de alta qualidade (AlphaFold2/Modeller) com validação (Ramachandran, ERRAT, Verify3D).
  4. Docking molecular: Docking completo de proteína-ligante, proteína-proteína e proteína-DNA usando AutoDock Vina, MoleDock ou HADDOCK.
  5. Simulações MD (GROMACS): Simulações avançadas de complexos. Forneço gráficos de RMSD, RMSF, Raio de Gyração, estabilidade de ligações de hidrogênio e SASA.
  6. Energia de ligação: Cálculos precisos de afinidade usando métodos MMPBSA/GBSA.
  7. QSAR & ML: Modelos de Aprendizado de Máquina para prever atividade e toxicidade de compostos.

Por que trabalhar comigo? Eu não apenas executo softwares; eu produzo soluções para críticas complexas em bioinformática.

Você receberá:

  • Imagens de visualização 3D de alta resolução.
  • Gráficos e tabelas de dados de qualidade para publicação.
  • Relatórios detalhados de metodologia para seus manuscritos.

Domínio:

Machine learning

Outros

Especialidade:

Análise preditiva

Linguagem de programação:

Python

Ferramentas:

caderno Jupyter

Excel

Outros

Tecnologia:

Python

Colab

Excel

Outros

Modelos e métodos:

Machine learning

Aprendizagem supervisionada