Eu processarei e analisarei seus dados de genômica ou vcf usando python
Desenvolvedor Python Bioinformática Analista de Dados
Sobre este Serviço
Você tem dados de genômica que precisam de processamento, filtragem ou
anotação, mas não sabe por onde começar?
Vou montar um pipeline de bioinformática confiável para processar seus
dados de VCF, BCF ou GWAS usando ferramentas padrão do setor, entregando
resultados limpos, anotados e prontos para análise.
O que posso fazer:
Processamento de arquivo VCF/BCF e conversão de formato
Filtragem de variantes por qualidade, profundidade e frequência de alelos
Anotação de SNP usando Ensembl VEP
Processamento de dados GWAS baseado em PLINK
Estatísticas de QC e relatórios resumidos com bcftools
Conversões de formato de arquivo (VCF, BCF, PLINK, haps/amostras)
Automação de workflows completos com Python
Visualização de dados de distribuições de variantes e métricas de qualidade
O que você receberá:
Arquivos de saída processados e filtrados
Relatório resumido de QC
Script de pipeline em Python (limpo, comentado, reutilizável)
Documentação clara e instruções de uso
Trabalho com bcftools, tabix, PLINK, Ensembl VEP e Python
as mesmas ferramentas usadas em pipelines de pesquisa de GWAS e genômica em produção.
Me envie uma mensagem antes de fazer o pedido para descrever seu conjunto de dados e seus objetivos.

