Eu processarei e analisarei seus dados de genômica ou vcf usando python

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Desenvolvedor Python Bioinformática Analista de Dados

Desenvolvedor Python e analista de bioinformática com experiência prática em fornecer soluções de dados em pesquisa e indústria. Especializo-me em: - Scripts em Python para limpeza, automação e análi...
Sobre este Serviço

Você tem dados de genômica que precisam de processamento, filtragem ou

anotação, mas não sabe por onde começar?


Vou montar um pipeline de bioinformática confiável para processar seus

dados de VCF, BCF ou GWAS usando ferramentas padrão do setor, entregando

resultados limpos, anotados e prontos para análise.


O que posso fazer:

Processamento de arquivo VCF/BCF e conversão de formato

Filtragem de variantes por qualidade, profundidade e frequência de alelos

Anotação de SNP usando Ensembl VEP

Processamento de dados GWAS baseado em PLINK

Estatísticas de QC e relatórios resumidos com bcftools

Conversões de formato de arquivo (VCF, BCF, PLINK, haps/amostras)

Automação de workflows completos com Python

Visualização de dados de distribuições de variantes e métricas de qualidade


O que você receberá:

Arquivos de saída processados e filtrados

Relatório resumido de QC

Script de pipeline em Python (limpo, comentado, reutilizável)

Documentação clara e instruções de uso


Trabalho com bcftools, tabix, PLINK, Ensembl VEP e Python

as mesmas ferramentas usadas em pipelines de pesquisa de GWAS e genômica em produção.


Me envie uma mensagem antes de fazer o pedido para descrever seu conjunto de dados e seus objetivos.

Tecnologia:

Excel

caderno Jupyter

Pandas

RStudio

mySQL

Streamlit

Tipo de análise:

Análise quantitativa

Análise estatística

Especialidade:

Desenho experimental

Tendências

Algoritmos

Linguagem de programação:

Python

R

SQL

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