Eu farei tarefas complexas de bioinformática

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bioinformática

Sou bioinformata especializada em pipelines genômicos de alta capacidade e aplicações escaláveis em ciências da vida. Transformo dados biológicos complexos em insights de pesquisa que podem ser usados...
Sobre este Serviço

Serviços profissionais de bioinformática para análise de dados de RNA-sequenciamento em massa e transcriptômica são fornecidos. Utilizando técnicas avançadas de biologia computacional, os dados brutos de sequenciamento são transformados em insights biológicos prontos para publicação.


A meta-análise de transcriptômica é realizada obtendo dados dos bancos de dados Gene Expression Omnibus (GEO) e TCGA. Após a análise de expressão diferencial de genes, uma rede de interação proteína-proteína (PPI) dos DEGs significativos é construída.


Serviços principais:

  • Pré-processamento de dados e análise estatística.
  • Análise de expressão diferencial de genes, miRNA e metilação.
  • Anotação funcional e análise de enriquecimento.
  • Caminhos de interação proteína-proteína e genética.
  • Análise de rede usando Cytoscape e R-programming.
  • Visualização de dados.


Infraestrutura & ferramentas:

  • R, Python.
  • Cluster de alto desempenho, RStudio, Anaconda, Jupyter, Docker, Spyder.


Recomenda-se comunicação prévia antes de fazer o pedido para discutir requisitos específicos do projeto e parâmetros do dataset.

Linguagem de programação:

Python

R

Tecnologia:

caderno Jupyter

Outros

Tipo de análise:

Análise Quantitativa

Análise Qualitativa

Especialidade:

Desenho experimental

Algoritmos

probabilidade

Ferramentas:

RStudio

Google Colab

Outros

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