Farei chamamento de variantes genômicas e anotação de genes usando gatk

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Ali Naqvi

Paquistão

Eu falo Urdu, Inglês

Especialista em Bioinformática e IA Biomédica

Sou especialista em Bioinformática e IA Biomédica, entregando resultados de pesquisa precisos e reprodutíveis. - Análise de NGS, RNA-seq e WGS - RNA-seq de célula única — agrupamento, UMAP, trajetóri...
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Sobre este Serviço

Você tem dados de sequências genômicas e precisa de ajuda com identificação de variantes ou anotação de genes? Eu realizo análises genômicas claras, bem documentadas e entrego resultados que você pode usar diretamente na sua pesquisa ou tese.


O que eu ofereço:

  • Controle de qualidade e trimming de sequências de DNA (FastQC, Trimmomatic)
  • Alinhamento ao genoma de referência (BWA, Bowtie2)
  • Chamamento de variantes SNP e indel (GATK, bcftools)
  • Anotação e filtragem de variantes (SnpEff, ANNOVAR)
  • Encontrar genes e anotação funcional (Prokka, BLAST)
  • Gráficos Manhattan, tabelas resumidas de variantes e relatório escrito


Todos os scripts (Python/Bash/R) estão incluídos para que sua análise seja totalmente reproduzível. Trabalho com genomas humanos, de plantas e microbianos.


Envie-me seus arquivos FASTQ ou VCF e detalhes do organismo antes de fazer o pedido.

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do genomics variant calling and gene annotation using gatk
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