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Vou fazer análise de bioinformática de rna seq, wgs, wes e ngs
Especialista em Bioinformática e Biologia Computacional
Precisa de análise confiável de bioinformática ou computacional para sua pesquisa?
Sou pesquisador de MS em Bioinformática na NUST, atuando em genômica, descoberta de medicamentos computacional e IA ...
Sobre este Serviço
Você tem dados de RNA-seq, NGS, WGS ou WES, mas precisa de um fluxo de trabalho bioinformático claro e reprodutível?
Ofereço análise de dados de bioinformática e genômica profissional para pesquisadores, estudantes e equipes de pesquisa, desde dados brutos de sequenciamento até interpretações biológicas significativas.
MEUS SERVIÇOS INCLUEM
- Análise de dados de RNA-seq e NGS
- Controle de qualidade e pré-processamento de FASTQ
- Trimagem e filtragem de leituras
- Alinhamento e quantificação
- Análise de expressão gênica
- Análise de expressão diferencial
- PCA, heatmaps e gráficos de vulcão
- Análise de dados de WGS e WES
- Chamada de variantes, filtragem e anotação
- Análise de transcriptômica
- Enriquecimento GO e KEGG
- Análise GSEA e de vias metabólicas
- Análise estatística e visualização
- Conjuntos de dados públicos como GEO e TCGA
- Fluxos de trabalho reprodutíveis de bioinformática
- Figuras e tabelas de qualidade para publicação
FERRAMENTAS
Python | R | Linux | FastQC | MultiQC | STAR | HISAT2 | BWA | SAMtools | featureCounts | DESeq2 | GATK | bcftools e outras ferramentas específicas de projetos de bioinformática.
Envie seu objetivo de pesquisa e dados disponíveis, e ajudarei a determinar o fluxo de trabalho de análise adequado.
Perguntas frequentes
Tradução automática
Que tipos de dados de sequenciamento você pode analisar?
Posso trabalhar com conjuntos de dados de RNA-seq, WGS, WES e outros de NGS. Dependendo do projeto, posso começar de arquivos FASTQ brutos, arquivos BAM, matrizes de contagem, arquivos VCF ou dados genômicos processados.
Você pode começar a partir de arquivos FASTQ brutos?
Sim. Posso começar de arquivos de sequenciamento brutos e realizar controle de qualidade, pré-processamento, alinhamento ou quantificação e análise downstream adequada.
Você realiza análise de expressão diferencial de RNA-seq?
Sim. O fluxo de trabalho pode incluir geração de contagens, normalização, expressão diferencial, PCA, heatmaps, gráficos de vulcão e interpretação biológica.
Você realiza análise de WGS e WES?
Sim. Dependendo do projeto, a análise de WGS/WES pode incluir QC, alinhamento, processamento de BAM, chamada de variantes, filtragem, processamento de VCF e anotação.
Você pode realizar enriquecimento GO, KEGG e de vias?
Sim. O enriquecimento funcional pode incluir GO, KEGG, GSEA ou outras análises de vias apropriadas, dependendo do organismo e dos identificadores de genes disponíveis.
Quais ferramentas você usa?
As ferramentas são selecionadas de acordo com o conjunto de dados e o desenho do estudo. Ferramentas comuns incluem FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, BWA, SAMtools, featureCounts, DESeq2, GATK e bcftools, juntamente com Python, R e Linux.
