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eu vou executar simulações de dinâmica molecular 100ns 33 análise com Gromacs
Biorroboteólogo, Bioinformática CADD e Pesquisa Científica, Pesquisa de PI
Apoiando pesquisas em ciências da vida por meio de serviços de descoberta de drogas computacional e bioinformática. A BTGenZ é especializada em docking molecular, simulações de dinâmica molecular (MD)...
Sobre este Serviço
Usando GROMACS, ofereço simulações e um pacote completo de análise 33, sujeito à compatibilidade do sistema.
O que você recebe:
- Estabilidade Estrutural: RMSD, RMSF, raio de giração (Rg), SASA e DSSP.
- Interações Moleculares: Ligações de hidrogênio, pontes de sal, contatos hidrofóbicos, impressões digitais ProLIF, análise de distância, ângulo e dihedral.
- Energia de Ligação: MM-PBSA e MM-GBSA.
- Análise Avançada: PCA, DCCM, agrupamento de trajetórias, paisagem de energia livre (FEL) e análise de Ramachandran.
- Análises adicionais: QC, centralização PBC, dinâmica de hidratação, RDF, MSD, densidade espacial, dinâmica de bolsões, área de interface, descritores de forma e estruturas representativas, além de análises especializadas aplicáveis.
- Saídas: Arquivos brutos de simulação, dados numéricos, gráficos de análise e estruturas/trajetórias processadas quando aplicável.
Relatório HTML interativo: $300 a mais. Veja uma amostra: https://sujay-19m.github.io/BTGenZ-Molecular-Dynamics-Scientific-Report/
Precisa de simulações mais longas, docking molecular, QSAR ou serviços integrados de CADD? Envie uma mensagem para obter preços personalizados antes de fazer o pedido.
Domínio:
Outros
Especialidade:
Outros
Linguagem de programação:
Python
Ferramentas:
Outros
Tecnologia:
Outros
Modelos e métodos:
Outros
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Vou receber todas as 33 análises para qualquer duração de simulação, incluindo 1 ns ou 100 ns?
Sim. Todo pacote padrão de simulação MD inclui o pacote completo de 33 análises, seja você escolher 1 ns, 100 ns ou uma duração maior. A aplicabilidade da análise depende do seu sistema molecular e do objetivo da pesquisa.
Posso solicitar apenas análises específicas em vez de todas as 33?
Sim. Pacotes de análise personalizados estão disponíveis se você precisar de resultados específicos. Você deve selecionar um mínimo de 13 a 16 análises. Se precisar de mais de 16 análises, pergunte sobre nossos pacotes agrupados para melhor custo-benefício.
Você tem uma tabela de preços para durações de simulação e análises personalizadas?
Sim. Temos uma tabela de preços detalhada para durações de simulação e módulos de análise individual. Envie uma mensagem antes de fazer o pedido se precisar de uma combinação personalizada ou de uma simulação além dos pacotes listados.
Quais entregas receberei?
Você receberá os resultados brutos da simulação, dados de análise numérica, gráficos e estruturas ou trajetórias processadas quando aplicável. Um relatório científico HTML interativo está disponível separadamente por $300. Veja uma amostra: https://sujay-19m.github.io/BTGenZ-Molecular-Dynamics-Scientific-Report/
Você oferece serviços de docking molecular, QSAR ou CADD integrado?
Sim. Além de simulações de dinâmica molecular baseadas em GROMACS, ofereço docking molecular, modelagem QSAR e serviços de CADD integrados. Envie uma mensagem antes de fazer o pedido para discutirmos seus requisitos de pesquisa, escopo, preços e prazo de entrega.
