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Vou analisar seus dados de microbioma 16s usando qiime2 bioinformática
Olá, meu nome é Steven Criollo. Sou engenheiro de biotecnologia com mestrado em bioinformática e biostatística. Ensino bioinformática e também trabalho como bioinformata para uma empresa de sequenciam...
Sobre este Serviço
Tipos de análise:
ANÁLISE BÁSICA:
- Controle de qualidade dos dados.
- Remoção de ruído e agrupamento (ASV).
- Classificação taxonômica.
- Abundância relativa.
- Árvore filogenética.
ANÁLISE PADRÃO:
Análise básica +
- Curvas de rarefação.
- Análise de diversidade alfa: índice de Shannon, recursos observados, diversidade filogenética de Faith, uniformidade de Pielou.
- Análise de diversidade beta: distância de Jaccard, distância de Bray-Curtis, distância de UniFrac não ponderada, distância de UniFrac ponderada.
- Métodos de ordenação: Análise de coordenadas principais (PCoA), Aproximação de Manifold Uniforme e Projeção (UMAP).
- Teste de abundância diferencial com ANCOM-BC.
- Testes de significância estatística: Kruskal-Wallis, PERMANOVA (ADONIS), ANOSIM, PERMDISP.
ANÁLISE PREMIUM:
Análise padrão +
- Reações enzimáticas (EC).
- Genes (KO / Ortologia KEGG).
- Caminhos metabólicos (MetaCyc).
- Análise comparativa.
Notas:
*Os pacotes Padrão e Premium requerem informações do grupo experimental e pelo menos 3 replicatas biológicas por grupo para realizar análises de diversidade e estatísticas.
*O preço listado é por amostra. Descontos estão disponíveis para projetos com várias amostras.
Perguntas frequentes
Tradução automática
Como vou receber meus resultados?
Seus resultados são entregues por meio de um link de armazenamento na nuvem contendo todos os arquivos gerados durante a análise, incluindo arquivos do QIIME2 (.qza/.qzv), figuras, tabelas prontas para publicação e um relatório em HTML com uma explicação passo a passo da análise e uma apresentação clara e fácil de entender de todos os resultados.
