Vou realizar docking molecular e triagem virtual para descoberta de medicamentos

Ajudo pesquisadores, startups e estudantes a transformar uma proteína alvo e um conjunto de compostos candidatos em previsões de ligação classificadas e defensáveis.

Usando AutoDock Vina, realizo docking molecular baseado em estrutura: preparação da proteína e do ligante, configuração da caixa de grade ao redor do sítio de ligação, execuções de docking e visualização do pose de ligação no PyMOL. Para conjuntos maiores de compostos, faço triagem virtual em lote e retorno uma tabela classificada de afinidade de ligação para que você possa priorizar quais moléculas perseguir experimentalmente.

Minha formação é em química computacional e física (MSc, Química Física), com experiência prática em estudos de docking e dinâmica molecular, incluindo um fluxo de trabalho de docking e MD para EGFR. Também trabalho com GROMACS para validação de MD, então um resultado de docking pode ser seguido por uma simulação curta para verificar a estabilidade do pose.

O que você recebe: um resumo claro dos métodos, imagens do pose de ligação, uma tabela de resultados classificados para trabalhos com múltiplos ligantes e comunicação honesta — vou te dizer claramente se seu alvo ou conjunto de ligantes tem alguma limitação conhecida, ao invés de prometer resultados que o docking sozinho não pode entregar.

Envie uma mensagem com seu proteína (ID PDB ou arquivo de estrutura) e ligante(s) antes de fazer o pedido.