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Eu vou processar dados de fastq de sequenciamento de RNA em massa e realizar análise de expressão diferencial
Bioinformática e Análise de Dados de Sequenciamento
Sou estudante de doutorado em Informática Médica, com formação em Medicina Clínica e pesquisa publicada em bioinformática. Processos dados de RNA-seq em massa, dados de FASTQ de célula única usando Ce...
Sobre este Serviço
Processamento de RNA-seq em lote: $8 USD por amostra.
Preços por volume por pedido: 1-5 amostras $8 cada; 6-19 $7,20; 20-49 $6,40; 50-99 $5,60; 100+ $4,80. O maior desconto elegível se aplica a todas as amostras; não acumulativo.
Pacotes: 5 amostras $40; 25 amostras $160; 50 amostras $280. Envie mensagem para outras quantidades e uma oferta personalizada. Taxas/impostos do comprador na Fiverr são separados.
Fluxo de trabalho: FastQC/fastp, HISAT2, featureCounts, além de um contraste DESeq2, PCA, volcano/heatmap e GO ou GSEA quando o desenho do estudo os suportar. Uma única amostra suporta apenas processamento upstream; análise diferencial requer replicatas biológicas.
Humano, rato ou camundongo; referência adequada necessária. Até 30 milhões de pares de leitura por amostra. Mesma referência e fluxo de trabalho acordado por pedido. Entregas: QC, tabelas, scripts/parâmetros, README de métodos em inglês e uma revisão de scope-fix.
Envie contagem de amostras, ensaio, profundidade, grupos e referência antes de pedir. Contrastes extras, referências especiais e dados mais aprofundados requerem um escopo separado. Transferência de dados autorizada apenas. Processamento apenas; não oferece serviço de download standalone. Uso para pesquisa; sem interpretação clínica ou garantia de significado.
Linguagem de programação:
R
Tecnologia:
Outros
Tipo de análise:
Análise Quantitativa
•
análise estatística
Especialidade:
Estatísticas
•
teste de hipóteses
Ferramentas:
RStudio
Perguntas frequentes
Tradução automática
O que devo enviar antes de fazer o pedido?
Envie o organismo, o ensaio, a quantidade de amostras, a quantidade de pares de leitura, a build de referência e os metadados das amostras com grupos e contrastes. Todos os pacotes aceitam FASTQ. A análise diferencial precisa de um desenho de estudo adequado e replicatas biológicas. Combine um método autorizado e seguro de transferência de dados antes de fazer o pedido.
