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Vou realizar docking molecular e análise de drogas in silico
Oi, eu sou a Safa A, formada em Bioquímica pelo mestrado e consultora em pesquisa científica. Sou especializada em redação de propostas de pesquisa, docking molecular, descoberta de medicamentos por m...
Sobre este Serviço
Sou pesquisador de Bioquímica com experiência publicada em descoberta de drogas computacional, docking molecular, simulações de dinâmica molecular e análise farmacocinética. Ofereço serviços profissionais de descoberta de drogas in silico para pesquisadores, estudantes e projetos farmacêuticos.
Serviços oferecidos
Preparação de proteínas
- Recuperação de estrutura de proteína do PDB
- Limpeza e otimização da estrutura
- Purificação de proteína
- Identificação do sítio ativo
Preparação de ligantes
- Recuperação de ligantes do PubChem, ChEMBL ou estruturas fornecidas pelo usuário
- Conversão de formato para estudos de docking
Docking molecular
- Docking proteína-ligante
- Análise de afinidade de ligação
- Avaliação do pose de docking
- Identificação de resíduos-chave na interação
Análise de interação
- Diagramas de interação 2D
- Análise de ligações de hidrogênio
- Interações hidrofóbicas
- Ponte de sal e π-interações
- Figuras de qualidade para publicação
Softwares & Ferramentas
- AutoDock
- AutoDock Vina
- Discovery Studio Visualizer
- PyMOL
Perguntas frequentes
Tradução automática
Q: Que informações você precisa para começar o projeto?
A: Por favor, forneça a proteína alvo (ID PDB ou arquivo de estrutura) e o(s) ligante(s) em formato SDF ou PDB. Se você não tiver esses arquivos, posso orientá-lo.
Q: Qual software você usa para docking molecular?
Eu uso AutoDock, AutoDock Vina, Discovery Studio Visualizer, PyMOL e outras ferramentas padrão de bioinformática.
Q: Vou receber um relatório detalhado?
A: Sim. Todos os pacotes incluem um relatório contendo pontuações de docking, análise de interação e visualizações.
Q: Você pode ajudar com projetos de pesquisa acadêmica?
Sim. Posso ajudar em projetos de mestrado, MPhil, doutorado e pesquisas que requerem análise de descoberta de drogas computacional.
Q: Os resultados são adequados para publicação?
As análises seguem fluxos de trabalho computacionais padrão; no entanto, a adequação para publicação depende do desenho geral do estudo e dos requisitos da revista.
Q: Você oferece triagem virtual de múltiplos compostos?
Sim. Por favor, entre em contato comigo antes de fazer o pedido para projetos personalizados envolvendo grandes bibliotecas de compostos.
Q: Seus dados serão mantidos confidenciais?
Com certeza. Todos os arquivos, estruturas e detalhes do projeto são tratados confidencialmente e nunca são compartilhados com terceiros.
