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Eu farei análise de DEGs e vias em bulk RNA-seq
Bioinformática Genômica R Python ML e Escrita Científica
Sou Saad, especialista em bioinformática e biologia computacional focado em genômica de plantas, anotação de genomas, RNA-seq, análise de dados, R, Python e escrita científica. Através do Saad Genomic...
Sobre este Serviço
Bem-vindo ao meu GiG,
Você está procurando por uma análise de RNA-seq em bulk que seja precisa, reprodutível e pronta para publicação?
Ofereço análise personalizada de dados transcriptômicos para pesquisadores, laboratórios e profissionais de biotecnologia. Posso trabalhar com matrizes de contagem bruta ou arquivos FASTQ, dependendo do pacote escolhido.
Os serviços podem incluir:
- Controle de qualidade de FASTQ e relatórios MultiQC
- Trimming de leitura, alinhamento ou quantificação de transcriptos
- Geração de contagem a nível de gene
- Normalização, PCA e correlação entre amostras
- Análise de expressão diferencial
- Gráficos de volcano, MA e heatmaps
- Enriquecimento de Gene Ontology e vias
- Figuras e tabelas de resultados prontos para publicação
- Scripts em R e relatório de interpretação clara
Utilizo ferramentas estabelecidas como FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, Salmon, DESeq2, edgeR e clusterProfiler em ambiente Linux.
Por favor, entre em contato antes de fazer o pedido para arquivos brutos FASTQ, organismos não-modelo, designs complexos ou mais de 12 amostras. Os resultados dependem da qualidade dos dados e do desenho experimental.
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Você aceita arquivos brutos FASTQ?
Sim. O processamento de FASTQ está incluído no pacote Premium ou pode ser fornecido por meio de uma oferta personalizada. Por favor, envie o número de amostras, tipo de sequenciamento e tamanhos aproximados dos arquivos antes de fazer o pedido.
Você pode analisar uma matriz de contagem existente?
Sim. Por favor, forneça a matriz de contagem inteira bruta, metadados das amostras e as comparações que deseja realizar.
Quais organismos você pode analisar?
Posso analisar conjuntos de dados de plantas, microrganismos, animais e humanos quando recursos de genoma de referência, transcriptoma e anotação adequados estiverem disponíveis.
Você fornecerá figuras prontas para publicação?
Sim. As figuras podem ser entregues em formato PNG, TIFF, PDF ou SVG, de acordo com o pacote escolhido e os requisitos de publicação.
Você fornecerá o código de análise?
Scripts de análise estão incluídos nos pacotes Standard e Premium. Eles também podem ser adicionados ao pacote Basic como um extra.
Você garante genes ou vias significativos?
Não. Os resultados dependem da qualidade da amostra, profundidade de sequenciamento, variação biológica e desenho experimental. Forneço uma análise transparente, sem manipular ou fabricar resultados.
