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Vou prever estrutura de proteína usando alphafold e realizar análise de docking
Redator de Currículo, CV e Carta de Apresentação Especialista em Ciência e Academia
Ajudo estudantes, pesquisadores e profissionais de duas formas: criando currículos, CVs e cartas de apresentação claros e otimizados para ATS, e realizando previsão de estrutura de proteínas e análise...
Sobre este Serviço
Precisa de uma estrutura 3D para uma proteína que você está estudando, mas não existe estrutura experimental? Eu uso AlphaFold (via ColabFold) para prever estruturas precisas de proteínas em 3D diretamente a partir da sua sequência de aminoácidos, além de análise de docking molecular opcional e visualizações limpas.
Como estudante de Microbiologia e Genética Molecular, entendo a biologia por trás dos dados, não apenas o software, então posso ajudar a interpretar os resultados, não apenas gerar arquivos.
O que você recebe:
- Uma estrutura 3D prevista (arquivo PDB) a partir da sua sequência
- Pontuações de confiança (pLDDT) explicadas de forma simples
- Análise de docking opcional com um ligante ou segunda proteína
- Imagens de visualização limpas, adequadas para relatórios ou apresentações
- Código fonte e um resumo escrito nos níveis superiores
Importante: estruturas previstas são estimativas computacionais, mais indicadas para pesquisa, trabalhos acadêmicos e geração de hipóteses. Para publicação ou uso clínico com certeza, validação experimental ainda é recomendada, e sempre serei transparente sobre os níveis de confiança.
Me envie sua sequência ou ID do PDB e o que você quer descobrir. Ficarei feliz em orientar antes de você fazer o pedido!
Linguagem de programação:
Python
•
R
•
Colab
Frameworks:
Outros
APIs:
Outros
Ferramentas:
caderno Jupyter
•
Colab
•
Outros
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Perguntas frequentes
Tradução automática
Quão precisa é a previsão do AlphaFold?
Muito precisa para muitas proteínas, muitas vezes com qualidade próxima à experimental. Sempre informo a pontuação de confiança (pLDDT) para que você saiba em que confiar em cada região da estrutura.
Isso substitui a determinação experimental de estrutura?
Não — é um ponto de partida forte para pesquisa e geração de hipóteses, mas publicação ou uso clínico geralmente ainda requer validação experimental (X-ray/cryo-EM).
Qual a diferença entre os pacotes?
Previsão de estrutura fornece o modelo 3D principal. Previsão + Docking adiciona análise de interação com um ligante ou proteína. O pacote de análise completo inclui tudo, mais código fonte e um relatório detalhado por escrito.
Quais formatos de arquivo eu recebo?
Um arquivo PDB para a estrutura, imagens de visualização PNG/JPG e (nos pacotes Standard/Premium) um resumo escrito em PDF ou Word.
Você consegue lidar com proteínas grandes ou complexos de proteínas?
Sim, dentro do razoável — me envie sua sequência antes de pedir para eu confirmar a viabilidade e o prazo.
Você oferece isso para estudantes com orçamento apertado?
Sim — o pacote de Previsão de Estrutura tem preço específico para trabalhos acadêmicos e uso estudantil.
