Eu vou executar docking molecular e simulações de dinâmica molecular

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Químico Computacional, Cálculos de DFT e Dinâmica Molecular

Sou pesquisador de química computacional com experiência em cálculos de Teoria do Funcional de Densidade (DFT), modelagem molecular e simulações de Dinâmica Molecular (MD). Meus interesses de pesquisa...
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Sobre este Serviço

Eu ofereço serviços profissionais de simulação de dinâmica molecular (MD) usando GROMACS para biologia computacional, descoberta de fármacos e estudos de interação proteína-ligando. Meu foco é entender a estabilidade de proteínas, interações moleculares e dinâmica estrutural por meio de fluxos de trabalho computacionais confiáveis e análises científicas.


Meus serviços incluem

  1. Configuração de MD: preparação de sistemas proteína e proteína-ligando, seleção de campo de força, solvatização, adição de íons, minimização de energia e balanceamento.
  2. Simulação de Dinâmica Molecular: simulações MD de produção para investigar a estabilidade da proteína, mudanças conformacionais e interações proteína-ligando.
  3. Análise de Trajetória: RMSD, RMSF, raio de gyration (Rg), área de superfície acessível à solvente (SASA), análise de ligações de hidrogênio e avaliação da estabilidade estrutural.
  4. Relatórios Científicos: gráficos de qualidade de publicação, visualização molecular, interpretação de resultados e dados computacionais organizados.


Ferramentas e Software

GROMACS, PyMOL, UCSF Chimera e ferramentas relacionadas de análise molecular, dependendo dos requisitos do projeto.

Entregáveis

  • Gráficos e figuras de trajetória MD
  • Análise estrutural e de interações e Relatório


Envie-me uma mensagem antes de fazer o pedido.

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