Vou construir uma árvore filogenética e analisar suas sequências de genes AMR

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Paquistão

Eu falo Inglês, Urdu

Analista de Bioinformática, Especialista em AMR e Filogenia

Ajudo pesquisadores a analisar seus dados de forma eficiente, combinando expertise em biologia molecular de laboratório com bioinformática computacional. Como estudante de mestrado em Bioquímica e Bio...
Sobre este Serviço

Está tendo dificuldades para visualizar as relações evolutivas dos seus genes de resistência antimicrobiana (AMR)? Sou estudante de mestrado em Bioquímica e Biologia Molecular, com experiência prática em diagnósticos moleculares de saúde pública. Combino meu profundo entendimento biológico com pipelines automatizados de bioinformática para fornecer análises filogenéticas prontas para publicação.


O que farei por você:

  • Recuperação automatizada de sequências do NCBI (ou trabalho com seus arquivos FASTA fornecidos).
  • Alinhamento de múltiplas sequências usando Clustal Omega.
  • Construção de árvore filogenética (Neighbor-Joining) com 100 réplicas de bootstrap.
  • Relatório claro em PDF de 1 página interpretando o significado biológico (por exemplo, evidências de transferência horizontal de genes ou expansão clonal).

Por que me escolher?

Não apenas clico botões em softwares. Escrevo scripts em Python (Biopython) que garantem que sua análise seja reproduzível e rápida. Meu background em laboratório em Teste de Suscetibilidade a Antimicrobianos (AST) e PCR significa que entendo o contexto clínico dos seus genes de resistência, não apenas o código.


Entregáveis:

  • Uma imagem de árvore em alta resolução.
  • O arquivo FASTA alinhado.
  • Um relatório em PDF com metodologia completa e interpretação.

Linguagem de programação:

Python

Tecnologia:

caderno Jupyter

Tipo de análise:

análise estatística

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Análise Preditiva

Especialidade:

Algoritmos

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Estatísticas

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Análise de Cluster

•

Outros

Ferramentas:

Jamovi

•

Google Colab

•

Microsoft Excel

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