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Eu farei análise de dados de ngs
bioinformática
Ofereço serviços de análise de dados de NGS, especializando-me em transformar dados brutos de sequenciamento (FASTQ) em resultados de variantes de alta qualidade (VCF).
Meu fluxo de trabalho inclui:
...
Sobre este Serviço
Ofereço serviços profissionais de análise de dados de NGS, especializando-me em transformar dados brutos de sequenciamento (FASTQ) em resultados de variantes de alta qualidade (VCF).
Realizarei um pipeline completo e confiável usando ferramentas padrão de bioinformática.
O que farei:
- Controle de qualidade do FASTQ (FastQC, fastp)
- Alinhamento de sequência usando BWA
- Processamento de BAM com SAMtools
- Chamada de variantes usando GATK
- Saída de VCF limpa e reproduzível
O que você receberá:
- Arquivos BAM processados
- Arquivo VCF final
- Resumo das etapas realizadas
️ Importante:
- Adequado para conjuntos de dados de pesquisa e acadêmicos
- Conjuntos de dados grandes podem exigir tempo/recurso adicional
Se você tiver requisitos específicos, sinta-se à vontade para me contatar antes de fazer seu pedido.
Tecnologia:
caderno Jupyter
•
RStudio
Especialidade:
Previsão
Linguagem de programação:
Python
•
R
•
SQL
Perguntas frequentes
Tradução automática
Que dados você precisa?
Arquivos FASTQ e genoma de referência (se disponível)
Você pode lidar com grandes conjuntos de dados?
Sim, mas conjuntos de dados grandes podem exigir tempo ou recursos adicionais.
Quais ferramentas você usa?
BWA, SAMtools, GATK, FastQC e fastp.
Você fornecerá interpretação?
Interpretação básica está incluída no pacote premium.
