Vou cuidar do trabalho braçal em bioinformática
Transformando dados bagunçados em informações limpas e fáceis de entender
Sobre este Serviço
O trabalho de bioinformática envolve muitas etapas cansativas que não aparecem na seção de métodos de um artigo, mas consomem horas do seu tempo:
- Executar QC em arquivos de sequenciamento brutos e interpretar o relatório
- Desvendar nomes de arquivos confusos em dezenas ou centenas de amostras
- Corrigir uma etapa do pipeline que fica falhando (Snakemake, Nextflow ou um script personalizado) devido a incompatibilidades de formato ou problemas de ambiente
- Formatando metadados para submissão no GEO/SRA
- Cruzar uma lista de genes/variante com bancos de dados e montar um resumo limpo e anotado
Esse é o trabalho braçal que é fácil de descrever, mas cansativo e propenso a erros na hora de executar, especialmente com arquivos reais, confusos e de tamanho completo. Tenho experiência prática em rodar essas ferramentas e solucionar os casos mais difíceis que aparecem.
Me diga o que está dando problema ou o que precisa fazer, e envie uma amostra dos seus dados. Eu te digo exatamente o que posso entregar e em quanto tempo.
Tecnologia:
Python
•
RStudio
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Powershell
Especialidade:
Extração de dados
•
Manipulação de dados
