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Vou construir uma montagem de cromossomo guiada por referência a partir do seu genoma de escaffold
Eu construo montagens de cromossomos guiadas por referência a partir do seu genoma de escaffold usando um pipeline personalizado em Python com alinhamento minimap2. Para solicitar, envie um número de acesso NCBI ou link direto para o seu genoma de referência e seu genoma de escaffold, ambos devem ser da mesma espécie. Cada entrega inclui o arquivo FASTA final do cromossomo montado mais um relatório completo de QC cobrindo % de cobertura de referência, % de identidade de alinhamento, N50 de contiguidade e análise de gaps, assim você pode verificar a qualidade por conta própria. O preço é baseado no tamanho do genoma de referência.