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Vou analisar dados de RNA seq com deseq2 e gráficos prontos para publicação
Analista de Dados de Omics Bioinformático
Oi, eu sou Maghooz Khan, um bioinformata profissional e desenvolvedor de IA. Trabalho com genômica, metagenômica, RNA-Seq, epigenética, metilação, análise de CNV e projetos de bioinformática baseados ...
Sobre este Serviço
Procurando análise de RNA-seq com tabelas claras, gráficos e interpretação biológica?
Vou analisar dados de RNA-seq em massa ou expressão gênica para pesquisa, tese, manuscrito ou projetos de biotecnologia. Posso trabalhar com arquivos FASTQ, matrizes de contagem, tabelas de expressão e arquivos de metadados.
Os serviços incluem:
- Controle de qualidade de RNA-seq e revisão de amostras
- Análise de expressão diferencial usando DESeq2 ou edgeR
- PCA, agrupamento de amostras, gráficos de vulcão e heatmaps
- Enriquecimento GO, KEGG, Reactome ou GSEA
- Tabelas limpas de DEG e resumos de expressão gênica
- Relatório em Word/PDF com interpretação clara
- Código de fluxo de trabalho em R/Python ou Linux quando necessário
As ferramentas podem incluir FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, Salmon, featureCounts, DESeq2, edgeR, clusterProfiler, ggplot2, R, Python e Linux.
Por favor, me envie uma mensagem antes de fazer o pedido para que eu possa confirmar o número de amostras, grupos, comparações, arquivos de entrada e o melhor pacote para seu projeto.
Perguntas frequentes
Tradução automática
Quais arquivos você precisa para começar?
Preciso de arquivos FASTQ, matriz de contagem, arquivo de metadados, detalhes do grupo de amostras e as comparações que você deseja analisar.
Você consegue analisar arquivos FASTQ brutos?
Sim, posso analisar arquivos FASTQ brutos usando um fluxo de trabalho completo de RNA-seq, incluindo QC, alinhamento ou quantificação, geração de contagens e análise downstream.
Você consegue trabalhar apenas com uma matriz de contagem?
Sim, se você já tiver uma matriz de contagem e metadados, posso fazer análise de expressão diferencial, visualizações, enriquecimento e relatórios.
Você fornece gráficos prontos para publicação?
Sim, posso fornecer gráficos PCA, gráficos de vulcão, heatmaps, gráficos de barras, gráficos de pontos e figuras de enriquecimento de vias.
