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Eu farei análise de dados de microbioma e metagenômica
Análise de microbioma, redação de projetos, edição de manuscritos, imunologia, oncologia
Sou pesquisador de doutorado em imunologia do câncer e ciência do microbioma na Laval University, Canadá. Nos últimos 5 anos, tive a sorte de publicar em revistas como Nature Communications e contribu...
Sobre este Serviço
Você está perdido em dados de sequenciamento, mas não sabe como analisá-los corretamente?
Sou pesquisador de doutorado em imunologia do câncer e ciência do microbioma na Laval University, Canadá. Analisei dados de 16S rRNA e metagenômica shotgun de coortes clínicas com mais de 600 amostras, publicados na Nature Communications, e apresentei em mais de 40 conferências internacionais. Sei o que os revisores esperam e o que faz as figuras estarem prontas para publicação.
O que posso analisar:
- Sequenciamento de amplicon 16S rRNA (DADA2, Phyloseq)
- Metagenômica shotgun (MetaPhlAn, Kraken/Bracken)
- Análise de diversidade alfa e beta
- Abundância diferencial (LefSe, ANCOM-BC2, MaAsLin2)
- Caminhos funcionais (HUMAnN)
- Montagem de metagenoma e anotação funcional
- RNA-seq em bulk (interações hospedeiro-microbioma)
Ferramentas: R, Python, DADA2, Phyloseq, MetaPhlAn, HUMAnN, clusters HPC
Você receberá: Análise limpa e totalmente reprodutível, figuras prontas para publicação (qualidade de revista), interpretação escrita clara dos seus resultados, todos os scripts em R e Python utilizados
Com quem trabalho: estudantes de doutorado, pesquisadores acadêmicos, startups de biotecnologia e equipes de pesquisa clínica na América do Norte, Europa e Ásia.
Não tem certeza se seus dados se encaixam? Me envie uma mensagem primeiro, vou te dizer honestamente o que é possível.
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Quais arquivos preciso fornecer?
Arquivos FASTQ brutos do seu sequenciador, junto com um arquivo de metadados (informações da amostra, grupos, condições). Se não tiver certeza do que compartilhar, envie uma mensagem primeiro e eu te orientarei.
Meus dados são de amostras clínicas humanas, tudo bem?
Sim, trabalho regularmente com dados de coortes clínicas humanas. Apenas garanta que seus dados estejam anonimizados e que você tenha a aprovação ética adequada do seu lado.
Preciso saber bioinformática para trabalhar com você?
De jeito nenhum. Eu cuido de toda a análise e explico os resultados em linguagem simples. Você só precisa entender sua biologia, eu cuido do código.
Em que formato as figuras serão entregues?
Arquivos PDF, SVG e PNG de alta resolução, prontos para submissão em revista. Também posso ajustar cores ou layouts conforme os requisitos da revista.
Você pode me ajudar a interpretar os resultados para meu manuscrito?
Sim. Todos os pacotes incluem uma interpretação biológica escrita. Nos pacotes Standard e Premium, forneço um texto detalhado pronto para discussão.
