Vou realizar docking molecular, simulação MD e análise admet

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docking molecular, simulação MD, descoberta de drogas, GROMACS, AutoDock Vina, ADMET,

docking molecular, simulação MD, descoberta de drogas, GROMACS, AutoDock Vina, ADMET, química computacional, bioinformática, triagem virtual, modelagem por homologia
Sobre este Serviço

Olá,


Sou pesquisador especializado em bioinformática e química computacional. Se você precisa de docking molecular, simulações de dinâmica molecular (MD) ou perfil de ADMET para seu projeto de pesquisa, tese ou artigo, posso ajudar a configurar e executar.


Utilizo simulações com GPUs de alta performance na nuvem (principalmente GROMACS e AutoDock Vina) para fornecer resultados rápidos e precisos.


O que posso ajudar:

Docking molecular: docking proteína-ligante (AutoDock Vina, PyRx), docking específico de sítio ou cego, triagem virtual e visualização de poses (PyMOL/Discovery Studio).

Simulações MD: configuração do sistema, equilíbrios e execuções de produção (10ns a 100ns+) em GROMACS ou NAMD. Vou analisar RMSD, RMSF, Rg, SASA, ligações de hidrogênio e energia de ligação MM-PBSA.

ADMET & Drug-likeness: perfil SwissADME/pkCSM e filtros da Regra de Cinco de Lipinski.

Modelagem por homologia: modelagem de estrutura 3D de proteína (SWISS-MODEL/Modeller) e validação.


O que você receberá:

Um relatório limpo e profissional com figuras prontas para publicação.

Todos os arquivos de saída brutos (.pdbqt, .gro, .xtc, .xvg, etc.) para seus registros.

Uma seção de metodologia escrita que você pode facilmente formatar para seu artigo ou tese.

Domínio:

Deep learning

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Outros

Especialidade:

processamento de imagem

•

Classificação

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agrupamento

Linguagem de programação:

Python

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SQL

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Amazon SageMaker

Ferramentas:

caderno Jupyter

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Tecnologia:

Python

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Modelos e métodos:

Machine learning

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