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Farei análise epigenética integrativa
Bioinformática simplificada
Analista principal na INTEGRATIVE BIOANALYTICS.
Sou bioinformatica líder e ex-cientista de laboratório molhado no Dana-Farber Cancer Institute e na UT Southwestern. Minhas prioridades são rigor cient...
Sobre este Serviço
O que está incluído:
ATAC-seq / ChIP-seq / Cut & Run/Tag
Controle de qualidade completo
Alinhamento + chamada de picos (Bowtie2/MACS3)
Picos de consenso, sobreposição e sinal.
Análise de picos diferenciais (DiffBind)
Visualização: PCA, gráfico de volcano interativo.
Anotação de picos genômicos (ChIPseeker)
Anotação funcional de picos (ENCODE-SCREEN)
Faixas do genoma para visualização (BigWig)
Anotação personalizada com conjuntos de dados de interesse.
Footprinting de proteínas baseado em evidências (LOLA/ReMap2022)
Análise de motivos conhecidos e de novo (HOMER).
Análise de vias baseada em domínios regulatórios (GREAT)
Relatório biológico
Relatório de QC
Relatório técnico
Revisões menores e consultoria.
Perguntas frequentes
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Até 6 amostras.
