Ver categorias
Explorar
Fiverr Pro
Português
$
USD
Irei analisar interações proteína-ligando para descoberta de fármacos
Redator Médico, CADD e Descoberta de Fármacos, Quimioinformática, Pesquisa Clínica
Sou uma Doutora em Farmácia (PharmD) em formação, com mais de um ano de experiência em escrita médica e de pesquisa. Combino uma base científica sólida com grande cuidado aos detalhes para produzir co...
Sobre este Serviço
Eu ofereço serviços de docking molecular para ajudar pesquisadores a investigar poses previstas de ligação do ligante, comparar compostos candidatos e visualizar interações dentro dos sítios de ligação da proteína.
Meus serviços incluem:
- Docking molecular usando AutoDock Vina ou PyRx
- Preparação de proteína e ligante, conforme o escopo do projeto acordado
- Análise de scores de docking e poses de ligação previstas
- Análise de interações proteína-ligante
- Diagramas de interação em 2D e visualizações moleculares em 3D
- Análise de ligações de hidrogênio e interações hidrofóbicas, quando aplicável
- Análise comparativa de múltiplos ligantes contra uma proteína-alvo
- Tabelas de resultados organizadas e relatórios científicos concisos
Ferramentas que posso usar:
AutoDock Vina, PyRx, PyMOL e Discovery Studio Visualizer, conforme os requisitos do projeto.
O que você receberá:
- Resultados de docking e visualizações da pose de ligação
- Figuras de interações proteína-ligante claramente rotuladas
- Tabelas de resultados comparativos, quando incluídas no seu pacote
- Um resumo conciso dos achados computacionais
- Documentação de métodos compatível com o escopo acordado
O que eu preciso de você:
Por favor, compartilhe a proteína-alvo, estruturas de ligantes ou identificadores de compostos, e o objetivo da pesquisa. Se houver disponível, forneça.
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Que informações você precisa para começar o docking molecular?
Preciso da estrutura da proteína-alvo (preferencialmente um arquivo PDB), estruturas de ligantes ou identificadores de compostos e o objetivo da pesquisa. Se tiver um ligante de referência ou um artigo de pesquisa, compartilhe também.
Você pode trabalhar com vários ligantes contra uma proteína?
Sim. Posso comparar vários ligantes contra uma única proteína-alvo de acordo com o pacote escolhido. Por favor, entre em contato comigo antes de encomendar grandes bibliotecas de compostos ou triagem virtual em larga escala.
Qual software você usa para docking molecular?
Dependendo dos requisitos do projeto, posso usar ferramentas como AutoDock Vina, PyRx, PyMOL e Discovery Studio Visualizer. Confirme o fluxo de trabalho necessário antes de fazer o pedido.
Receberei diagramas de interação proteína-ligando?
Sim. Diagramas de interação e visualizações moleculares são incluídos de acordo com o pacote selecionado. Podem incluir diagramas de interação 2D, poses de ligação 3D e interações relevantes de ligações de hidrogênio ou hidrofóbicas.
Você fornece um relatório científico com os resultados?
Sim. Dependendo do pacote, posso fornecer resultados de docking organizados, visualizações de poses de ligação, tabelas comparativas e um relatório conciso descrevendo o fluxo de trabalho computacional e os achados.
Uma pontuação de docking melhor prova que um composto é um fármaco eficaz?
Não. Scores de docking são previsões computacionais e não provam isoladamente afinidade de ligação, atividade biológica, segurança ou eficácia terapêutica. Pode ser necessária validação experimental ou computacional adicional.
Você pode realizar simulações de dinâmica molecular (MD) ou análise ADMET?
Essas são tarefas separadas do docking molecular básico. Por favor, entre em contato antes para confirmar a análise necessária, ferramentas disponíveis, escopo do projeto e entregáveis.
Você pode trabalhar com uma proteína que não tem estrutura PDB?
Possível, dependendo do alvo e da disponibilidade de uma estrutura adequada ou modelo confiável. Por favor, envie o nome da proteína ou a sequência antes de encomendar para avaliarmos a viabilidade.
E se eu precisar de alterações após a entrega?
Forneço revisões de acordo com o pacote selecionado. As revisões cobrem correções razoáveis aos entregáveis acordados; novos alvos, ligantes adicionais além do limite do pacote ou análises totalmente novas podem exigir uma encomenda adicional.
