Vou desenvolver pipelines de omics reproduzíveis

Pipelines reproduzíveis de RNA-Seq, DNA-Seq e Ribo-Seq

Você trabalha com dados de RNA-Seq, DNA-Seq ou Ribo-Seq e precisa de fluxos de trabalho de análise robustos e reproduzíveis?

Eu vou construir pipelines personalizados de omics usando Snakemake ou Nextflow, projetados para escalabilidade, clareza e reprodutibilidade.

Meus pipelines seguem as melhores práticas em bioinformática, são modulares, bem documentados e controlados por ambiente (Conda ou virtualenv). Seja você processando uma única amostra ou um lote completo de experimentos, vou ajudar a automatizar QC, alinhamento, quantificação e análise diferencial com flexibilidade para integrar ferramentas e visualizações downstream.

Este serviço inclui fluxos de trabalho de análise de RNA-Seq totalmente automatizados usando ferramentas como STAR, HISAT2 e DESeq2, do FASTQ bruto até a expressão diferencial final e visualizações.

• Fluxos de trabalho para amostras únicas e múltiplas
• Regras e parâmetros configuráveis
• Estrutura de saída clara e documentação
• Compatível com execução local ou HPC
• Saídas prontas para ML e hooks de enriquecimento opcionais

Vamos otimizar sua análise de omics e garantir que ela esteja pronta para publicação, seja reprodutível e preparada para o futuro.

Entre em contato comigo para discutir seu projeto antes de fazer seu pedido.