Eu vou executar simulação de dinâmica molecular e análise

"Precisa de uma simulação de dinâmica molecular MD confiável para sua proteína ou complexo proteína-ligante? Eu ofereço simulação e análise de MD de nível de pesquisa usando GROMACS, ajudando pesquisadores e estudantes a validar a estabilidade estrutural e o comportamento de ligação ao longo do tempo.

O que eu ofereço: simulações de MD de proteínas ou complexos proteína-ligante com configuração do sistema, minimização de energia, equalização e execuções de produção. A análise pós-simulação inclui RMSD, RMSF, raio de giração, análise de ligações de hidrogênio e cálculos opcionais de energia de ligação MM-PBSA/GBSA.

Ferramentas: GROMACS, VMD, PyMOL, Xmgrace para gráficos.

Você recebe: um relatório detalhado em PDF com todos os gráficos de análise, arquivos brutos de trajetória/saída e um resumo claro das descobertas sobre a estabilidade estrutural.

Por que me escolher: experiência prática em toda a cadeia computacional, desde docking até MD e análise de energia livre, para entender como seus resultados de simulação se encaixam no contexto maior do seu projeto.

Tenha pronto: a estrutura da sua proteína (arquivo PDB) e, se aplicável, a estrutura do ligante (PDB/MOL2/SDF). Me informe a duração desejada da simulação ou deixe a minha recomendação.

Envie-me os detalhes do seu sistema para um orçamento personalizado, vamos começar sua simulação