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Vou fazer docking molecular e simulações de MD
bioinformática
Sou bioinformata com 8 anos de experiência em pesquisa e trabalhos publicados em revistas de alto nível, incluindo Microbial Pathogenesis, Biomedicines e Scientific Reports. Na Fiverr, ofereço suporte...
Sobre este Serviço
Como fundador e CEO da DockDynamics, ofereço simulações de docking molecular e dinâmicas moleculares (MD) de nível especialista para apoiar projetos de descoberta de medicamentos computacionais. Se você está procurando um designer de medicamentos experiente, está no lugar certo. Vou ajudar você com projetos relacionados ao design de medicamentos e vacinas. Como bioinformata profissional, entrego resultados reprodutíveis, confiáveis e prontos para publicação.
Ferramentas e Recursos:
docking proteína-ligante (AutoDock Vina, PyRx, MOE)
Simulações de MD (GROMACS/AMBER/NAMD)
Análise de interação e estabilidade (RMSD, RMSF, Rg, SASA, PCA, DCCM, MMGBSA)
Cálculos de energia e visualizações (PyMOL, Chimera, Discovery Studio, LigPlus)
Análise ADMET e RO5 (SwissADME, AdmetSAR, ProTox-II)
Inclui relatórios detalhados, gráficos e scripts reprodutíveis (sob solicitação).
Por que me escolher?
1. Entrega rápida do pedido
2. Revisões
3. 100% satisfação do cliente
4. Garantia de devolução do dinheiro
5. Tarifas acessíveis
Sinta-se à vontade para me contatar para personalizar seu pedido.
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Quais arquivos de entrada você precisa de mim?
Normalmente, preciso da sua estrutura de proteína (formato PDB) e do(s) ligante(s) nos formatos MOL2/SDF/PDBQT.
Que software você usa?
Eu uso AutoDock Vina, PyRx, MOE para docking, e NAMD, GROMACS (ou AMBER mediante solicitação) para simulações de MD. As visualizações são criadas usando PyMOL, Chimera ou VMD.
Você consegue fazer simulações para qualquer proteína alvo?
Sim, desde que uma estrutura 3D válida esteja disponível (PDB ou modelo de homologia), posso realizar docking e simulações de MD para ela.
Vou receber um relatório?
Sim, cada pacote de simulação inclui um relatório detalhado em PDF com métodos, resultados, gráficos (por exemplo, RMSD, RMSF) e visuais de ligação.
Esses resultados são adequados para publicação ou trabalho de tese?
Com certeza, forneço visuais e dados prontos para publicação.
Meus dados são mantidos confidenciais?
Sim. Seus dados são totalmente confidenciais e assino um acordo de confidencialidade (NDA) se você exigir.
