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Vou te ajudar com docking de proteína, peptídeo, dna e simulação de md
Biólogo Computacional e Cientista de Dados
Uma bio-tecnóloga especializada em bioinformática, biologia computacional e descoberta de medicamentos in silico.
Como fundadora da DockVision, lidero uma consultoria que oferece soluções de pesquisa...
Nível 2
Atendeu a critérios de alto desempenho e tem um histórico comprovado de atendimento às expectativas dos clientes.
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Conhecido pela velocidade das respostas
Sobre este Serviço
DockVision é mais do que um serviço freelance comum. A maioria dos vendedores pode oferecer serviços de bioinformática. A verdadeira diferença está em saber qual método usar, como montar o workflow corretamente e como transformar a saída computacional bruta em resultados cientificamente significativos. É aí que minha expertise se destaca.
Sou um Cientista Computacional com mais de 5 anos de experiência prática e mais de 100 projetos concluídos para clientes de 30+ países. Eu gerencio workflows de pesquisa complexos que vão além de simplesmente rodar softwares e entregar resultados básicos.
Minha expertise inclui:
- Docking de proteína-ligante
- Docking de proteína-proteína
- Docking de proteína-DNA/RNA
- Docking de íons metálicos
- Docking de nanopartículas
- Docking de peptídeos
- Simulações de membranas
- Simulações de ácidos nucleicos
- Simulações de peptídeos/polímeros
- Simulações de amostragem aprimorada em MD
Análise pós-simulação:
- MM/PBSA & MM/GBSA
- PCA/DCCM/FEL
- SASA & Rg
- Análise de ligações de hidrogênio
- Análise de agrupamento
- Análise de interação proteína-ligante
- Análise de estrutura secundária
- Análise de mapa de contatos
- Análise de distância & ângulo
- Interação de resíduos
Meu objetivo é entregar uma análise cientificamente sólida, reprodutível, com interpretação clara, visualizações de qualidade para publicação e resultados bem organizados.
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
O que é acoplamento proteína-peptídeo?
O acoplamento proteína-peptídeo prevê como um peptídeo se liga a uma proteína-alvo e identifica interações-chave e locais de ligação.
Quais ferramentas você usa para acoplamento proteína-peptídeo?
Eu uso HADDOCK, ClusPro, AutoDock Vina, Rosetta FlexPepDock, Schrödinger e MOE para obter resultados de acoplamento precisos.
Você consegue analisar interações 2D e 3D?
Sim, forneço mapas detalhados de interação 2D e visualização estrutural 3D do complexo proteína-peptídeo.
Você realiza Dinâmica Molecular (MD) em complexos proteína-peptídeo?
Sim, simulo os complexos ao longo do tempo para estudar estabilidade, flexibilidade e dinâmica de interação.
Que análises são incluídas após a simulação de MD?
Inclui RMSD, RMSF, Raio de Giro (Rg), ligações de hidrogênio, SASA e energia livre de ligação (MM-PBSA/MM-GBSA).
Você consegue prever afinidade de ligação para peptídeos?
Sim, forneço pontuações de ligação e perfis de interação para classificar candidatos a peptídeos.
Seus resultados são adequados para publicação?
Sim, todos os relatórios incluem figuras, gráficos e interpretações científicas prontos para publicação.
Quanto tempo leva um projeto de acoplamento proteína-peptídeo?
Normalmente, o acoplamento leva de 1 a 3 dias; as simulações de MD dependem do tempo de simulação solicitado (por exemplo, 50–200 ns).
Avaliações
8 avaliações deste Serviço
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Mais relevante
M maalotaibi
Arábia Saudita
Colaboração contínuaThe quality of the work and the turnaround time are excellent. The service is highly professional, and I have worked with him several times.
US$ 100-US$ 200
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2 dias
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Útil?A aashamrani
Arábia Saudita
Colaboração contínuaVery good!
US$ 200-US$ 400
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Útil?J joy_hj
Estados Unidos
Colaboração contínuaExcellent delviery was asap
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Útil?J joy_hj
Estados Unidos
Colaboração contínuanice work recom
US$ 50
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Útil?J just_som_motion
Itália
Colaboração contínuaAttenzione ai dettagli, super consigliato
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