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eu vou fornecer serviços de docking e simulação de MD usando GROMACS
DockVision
Level 2
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Sobre este Serviço
Tradução automática
DockVision é uma consultoria de biologia computacional que traz rigor analítico para a pesquisa moderna de ciências da vida. Nos últimos cinco anos, trabalhamos em parceria com estudantes, investigadores acadêmicos, universidades, empresas de biotecnologia e instituições de pesquisa em todo o mundo, traduzindo perguntas estruturais, moleculares e genômicas intrincadas em fluxos de trabalho in-silico reproduzíveis.
Eu sou Ata, um cientista computacional com mais de cinco anos de experiência prática, 120+ projetos concluídos em mais de 30 países e 30+ publicações revisadas por paress em química computacional e medicinal, com laços de colaboração com Amaryllis Therapeutics e Cloverleaf Bio. Os serviços de bioinformática são amplamente disponíveis; discernimento não. A verdadeira diferença está em saber qual método uma pergunta exige e transformar a saída computacional bruta em conclusões de mérito científico duradouro.
Conheça mais sobre DockVision
DockVision
Computational Biologist and Data Scientist
Level 2
- A partir dePaquistão
- Membro desdeago. de 2022
- Responde em aprox.:1 hora
- Última entrega1 semana
Idiomas
Inglês, Espanhol, Alemão, Francês, Italiano
A computational scientist specializing in bioinformatics, computational biology and in-silico drug discovery.
As founder of DockVision, I direct a consultancy that delivers precision-engineered research solutions to an international clientele. With five years of distinguished practice and 90+ engagements across 30+ countries, our team orchestrates end-to-end computational pipelines with uncompromising scientific rigour, transforming intricate molecular challenges into publication-ready insight.
Tradução automática
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Você é um especialista em bioinformática?
Sim, tenho mais de 5 anos de experiência profissional em bioinformática, trabalhando com sucesso em docking molecular, simulações de dinâmica molecular e projetos avançados de pesquisa computacional para clientes internacionais.
Você consegue prever alvos de drogas?
Sim, trabalho com dados de sequência. Dependendo das necessidades do cliente, posso prever candidatos a alvos para fármacos, e a triagem virtual de drogas também é uma opção.
O preço é o mesmo para todas as tarefas mencionadas no Serviço?
Não, não é o mesmo para todos os projetos, depende do projeto e de sua extensão.
Que informações você precisa para começar o projeto?
Preciso da estrutura da proteína (ID PDB ou arquivo), estrutura do ligante/peptídeo e objetivos claros do projeto.
Qual software você usa?
Eu trabalho com AutoDock Vina, Schrödinger, MOE, HADDOCK, GROMACS, NAMD, ACEMD, Desmond, VMD, PyMOL, ChimeraX, CHARMM-GUI, AmberTools, PLUMED, Python, R, Bash/Linux, Claude Code, Cursor, Jupyter e bibliotecas de Python como MDAnalysis, MDTraj, ProDy, Biopython, NumPy, Pandas, Matplotlib e SciPy.
Qual o tempo das simulações de MD que você realiza?
Normalmente de 50 a 500 ns, dependendo dos requisitos do projeto. Simulações mais longas podem ser agendadas se necessário.
Você pode ajudar na interpretação dos resultados?
Sim, forneço uma interpretação científica clara para te ajudar a entender se seu complexo é estável e promissor.
Seu trabalho é adequado para publicação?
Sim, as análises e relatórios são preparados de acordo com os padrões acadêmicos e de pesquisa.
Que análises são incluídas após a simulação de MD?
RMSD, RMSF, raio de giração, análise de ligações de hidrogênio, SASA, estabilidade de interação e energia de ligação livre (MM-PBSA/MM-GBSA), PCA, DCCM, FEL, análise de clusters e muito mais.
Você consegue fazer screening virtual de grandes bibliotecas de compostos?
Sim, posso fazer screening de múltiplos compostos e classificá-los com base na afinidade de ligação e na qualidade da interação.
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M maalotaibi
Arábia Saudita
Colaboração contínuaThe order was delivered before the agreed time and the quality of work was good, I will do other service with him again
US$ 200-US$ 400
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6 dias
Tempo
Útil?J joy_hj
Estados Unidos
Colaboração contínuanice work N
US$ 200-US$ 400
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5 dias
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Útil?J joy_hj
Estados Unidos
Colaboração contínuagrt work and fast
US$ 50-US$ 100
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2 dias
Tempo
Útil?A aashamrani
Arábia Saudita
Colaboração contínuaoutstanding effort and truly excellent work.
US$ 400-US$ 600
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9 dias
Tempo
Útil?J just_som_motion
Itália
Colaboração contínuaOttimo lavoro ed attenzione ai dettagli
US$ 50-US$ 100
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H 
Resposta do freelancer
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