Vou fornecer serviços de docking e simulação de md


Level 2
Sobre este Serviço
Tradução automática
DockVision é mais do que um serviço freelance comum. A maioria dos vendedores pode oferecer serviços de bioinformática. A verdadeira diferença está em saber qual método usar, como montar o workflow corretamente e como transformar a saída computacional bruta em resultados cientificamente significativos. É aí que minha expertise se destaca.
Sou um Cientista Computacional com mais de 5 anos de experiência prática e mais de 100 projetos concluídos para clientes de 30+ países. Eu gerencio workflows de pesquisa complexos que vão além de simplesmente rodar softwares e entregar resultados básicos.
Minha expertise inclui:
- Docking de proteína-ligante
- Docking de proteína-proteína
- Docking de proteína-DNA/RNA
- Docking de íons metálicos
- Docking de nanopartículas
- Docking de peptídeos
- Simulações de membranas
- Simulações de ácidos nucleicos
- Simulações de peptídeos/polímeros
- Simulações de amostragem aprimorada em MD
Análise pós-simulação:
- MM/PBSA & MM/GBSA
- PCA/DCCM/FEL
- SASA & Rg
- Análise de ligações de hidrogênio
- Análise de agrupamento
- Análise de interação proteína-ligante
- Análise de estrutura secundária
- Análise de mapa de contatos
- Análise de distância & ângulo
- Interação de resíduos
Meu objetivo é entregar uma análise cientificamente sólida, reprodutível, com interpretação clara, visualizações de qualidade para publicação e resultados bem organizados.
Conheça mais sobre DockVision
Computational Biologist and Data Scientist
Level 2
- A partir dePaquistão
- Membro desdeago. de 2022
- Responde em aprox.:1 hora
- Última entrega2 dias
Idiomas
Inglês, Espanhol, Alemão, Francês, Italiano
Tradução automática
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Você é um especialista em bioinformática?
Sim, tenho mais de 5 anos de experiência profissional em bioinformática, trabalhando com sucesso em docking molecular, simulações de dinâmica molecular e projetos avançados de pesquisa computacional para clientes internacionais.
Você consegue prever alvos de drogas?
Sim, trabalho com dados de sequência. Dependendo das necessidades do cliente, posso prever candidatos a alvos para fármacos, e a triagem virtual de drogas também é uma opção.
O preço é o mesmo para todas as tarefas mencionadas no Serviço?
Não, não é o mesmo para todos os projetos, depende do projeto e de sua extensão.
Que informações você precisa para começar o projeto?
Preciso da estrutura da proteína (ID PDB ou arquivo), estrutura do ligante/peptídeo e objetivos claros do projeto.
Qual software você usa?
Eu trabalho com AutoDock Vina, Schrödinger, MOE, HADDOCK, GROMACS, NAMD, ACEMD, Desmond, VMD, PyMOL, ChimeraX, CHARMM-GUI, AmberTools, PLUMED, Python, R, Bash/Linux, Claude Code, Cursor, Jupyter e bibliotecas de Python como MDAnalysis, MDTraj, ProDy, Biopython, NumPy, Pandas, Matplotlib e SciPy.
Qual o tempo das simulações de MD que você realiza?
Normalmente de 50 a 500 ns, dependendo dos requisitos do projeto. Simulações mais longas podem ser agendadas se necessário.
Você pode ajudar na interpretação dos resultados?
Sim, forneço uma interpretação científica clara para te ajudar a entender se seu complexo é estável e promissor.
Seu trabalho é adequado para publicação?
Sim, as análises e relatórios são preparados de acordo com os padrões acadêmicos e de pesquisa.
Que análises são incluídas após a simulação de MD?
RMSD, RMSF, raio de giração, análise de ligações de hidrogênio, SASA, estabilidade de interação e energia de ligação livre (MM-PBSA/MM-GBSA), PCA, DCCM, FEL, análise de clusters e muito mais.
Você consegue fazer screening virtual de grandes bibliotecas de compostos?
Sim, posso fazer screening de múltiplos compostos e classificá-los com base na afinidade de ligação e na qualidade da interação.
55 avaliações deste Serviço
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Classificação detalhada
- Nível de comunicação do freelancer
- Qualidade da entrega
- Valor da entrega
Ordenar por
M maalotaibi

Arábia Saudita
Colaboração contínuaThe order was delivered before the agreed time and the quality of work was good, I will do other service with him again
US$ 200-US$ 400
Preço
6 dias
Tempo
Útil?J joy_hj

Estados Unidos
Colaboração contínuanice work N
US$ 200-US$ 400
Preço
5 dias
Tempo
Útil?J joy_hj

Estados Unidos
Colaboração contínuagrt work and fast
US$ 50-US$ 100
Preço
2 dias
Tempo
Útil?A aashamrani

Arábia Saudita
Colaboração contínuaoutstanding effort and truly excellent work.
US$ 400-US$ 600
Preço
9 dias
Tempo
Útil?J just_som_motion

Itália
Colaboração contínuaOttimo lavoro ed attenzione ai dettagli
US$ 50-US$ 100
Preço
2 dias
Tempo
H 
Resposta do freelancer
Útil?
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Útil?J just_som_motion

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