Vou fornecer serviços de docking e simulação de MD
Especialista em Biologia Computacional
Nível 2
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Sobre este Serviço
Olá!
DockVision está aqui, uma equipe confiável que oferece serviços profissionais de bioinformática computacional, bioestatística e modelagem & simulação molecular no Fiverr há mais de 5 anos. Já concluímos com sucesso mais de 90 projetos internacionais em diversos domínios de pesquisa e química computacional.
Com expertise em docking molecular, simulações de dinâmica molecular, modelagem de proteínas, triagem virtual baseada em farmacóforos, análise de afinidade de ligação, cálculos MM/PBSA e MM/GBSA, PCA, DCCM, RMSD, RMSF, SASA, RoG, análise de clusters e visualização de dados científicos usando GROMACS, NAMD, VMD, ACEMD, Desmond e Schrödinger, entregamos resultados precisos, prontos para publicação e de alta qualidade, adaptados às suas necessidades de pesquisa.
Domínio:
Outros
Linguagem de programação:
Python
•
R
•
MATLAB
•
SQL
•
Colab
Ferramentas:
caderno Jupyter
•
Excel
•
Colab
•
Outros
Tecnologia:
Python
•
R
•
SQL
•
MATLAB
•
Pandas
•
RStudio
Modelos e métodos:
Cluster computacional
•
Estatísticas
•
Outros
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Você é um especialista em bioinformática?
Sim, tenho mais de 5 anos de experiência profissional em bioinformática, trabalhando com sucesso em docking molecular, simulações de dinâmica molecular e projetos avançados de pesquisa computacional para clientes internacionais.
Você consegue prever alvos de drogas?
Sim, trabalho com dados de sequência. Dependendo das necessidades do cliente, posso prever candidatos a alvos para fármacos, e a triagem virtual de drogas também é uma opção.
O preço é o mesmo para todas as tarefas mencionadas no Serviço?
Não, não é o mesmo para todos os projetos, depende do projeto e de sua extensão.
Que informações você precisa para começar o projeto?
Preciso da estrutura da proteína (ID PDB ou arquivo), estrutura do ligante/peptídeo e objetivos claros do projeto.
Qual software você usa para docking?
Eu uso ferramentas padrão da indústria como AutoDock Vina, Schrödinger, MOE, GROMACS, DESMOND, HADDOCK e outras plataformas computacionais confiáveis.
Qual o tempo das simulações de MD que você realiza?
Normalmente de 50 a 500 ns, dependendo dos requisitos do projeto. Simulações mais longas podem ser agendadas se necessário.
Você pode ajudar na interpretação dos resultados?
Sim, forneço uma interpretação científica clara para te ajudar a entender se seu complexo é estável e promissor.
Seu trabalho é adequado para publicação?
Sim, as análises e relatórios são preparados de acordo com os padrões acadêmicos e de pesquisa.
Que análises são incluídas após a simulação de MD?
RMSD, RMSF, raio de giração, análise de ligações de hidrogênio, SASA, estabilidade de interação e energia de ligação livre (MM-PBSA/MM-GBSA), PCA, DCCM, FEL, análise de clusters e muito mais.
Você consegue fazer screening virtual de grandes bibliotecas de compostos?
Sim, posso fazer screening de múltiplos compostos e classificá-los com base na afinidade de ligação e na qualidade da interação.
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Ordenar por
A ahmedelabid2004
Cliente recorrente

Marrocos
The work was of a high standard and carried out with great scientific accuracy. I am very happy to work with him.
US$ 200-US$ 400
Preço
9 dias
Tempo
Útil?M maalotaibi

Arábia Saudita
The order was delivered before the agreed time and the quality of work was good, I will do other service with him again
US$ 200-US$ 400
Preço
4 dias
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Útil?J joy_hj
Cliente recorrente

Estados Unidos
grt work and fast
US$ 50-US$ 100
Preço
2 dias
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Útil?A aashamrani

Arábia Saudita
outstanding effort and truly excellent work.
US$ 400-US$ 600
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Útil?J just_som_motion
Cliente recorrente

Itália
Ottimo lavoro ed attenzione ai dettagli
US$ 50-US$ 100
Preço
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H 
Resposta do freelancer
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