Vou construir um pipeline automatizado de análise de sequência fasta em bash e python

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Paquistão

Eu falo Urdu, Inglês

transitando para Bioinformática

Atualmente aprimorando habilidades em fluxos de trabalho no terminal Linux, bancos de dados NCBI/EMBL-EBI e análise de sequências. 🎯 Com o objetivo de contribuir com ferramentas de bioinformática de ...
Sobre este Serviço

Você está procurando um pipeline automatizado confiável e de alta velocidade para processar sequências biológicas FASTA sem trabalho manual? 


Sou especialista em criar pipelines modulares, reproduzíveis em Bash e Python, feitos sob medida para extração de sequências FASTA do NCBI e análises bioinformáticas posteriores.


### O que ofereço neste serviço:

- Recuperação automatizada de sequências do NCBI: download em lote de sequências FASTA usando IDs de acesso.

- Estatísticas e métricas de sequência: calcular comprimento total, porcentagens de GC/AT e estatísticas N50.

- Perfil de GC baseado em janelas: análise detalhada do conteúdo de GC ao longo de janelas deslizantes.

- Manipulação de sequências: geração automática de complemento reverso e limpeza de cabeçalhos FASTA.

- Exportação de dados estruturados: relatórios limpos em TSV/CSV para análises posteriores.


### Por que escolher meu serviço?

- Código limpo e bem documentado: scripts modulares em Bash e Python, prontos para reutilização.

- Fluxos de trabalho otimizados para armazenamento: execução eficiente na linha de comando em ambientes Linux.

- Entrega rápida e suporte completo: instruções detalhadas para execução tranquila no seu terminal.


Sinta-se à vontade para me enviar uma mensagem com seus requisitos específicos antes de fazer seu pedido!

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