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Eu vou baixar e alinhar suas amostras fastq ao genoma
Como pesquisador de Ph.D. no Centro Nacional de Pesquisa do Câncer, minha especialização envolve fornecer análises avançadas de bioinformática, especialmente em áreas-chave como RNA-seq, CRISPR-Screen...
Nível 1
Atendeu a determinados critérios de desempenho e demonstra forte potencial no marketplace.
Sobre este Serviço
Dados públicos de microarray ou RNAseq são realmente úteis para diferentes análises. Esses arquivos são muito pesados, e é preciso uma infraestrutura computacional potente para obtê-los. Usando um HPC Linux, eu vou baixar todos os seus dados (amostras fastq) de bancos de dados públicos como SRA, ENA, NIH, etc. Vou alinhá-los ao genoma (humano, rato, zebrafish...) usando o alinhador STAR ou Salmon, e vou te entregar as contagens brutas com as quais você poderá fazer análises downstream.
Além disso, vou te fornecer um relatório em html com as métricas, estatísticas e passos de controle de qualidade das amostras alinhadas.
Cada amostra vai custar 5 dólares
Se tiver alguma dúvida, me escreve que a gente conversa!
Tecnologia:
Python
•
RStudio
•
Outros
Tipo de informação:
Listagens
•
Outros
Técnica:
Manual
