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Vou analisar seus dados de rna seq de célula única e fornecer insights personalizados
Codificando o futuro da biologia
Genyx LLC é uma empresa de biotecnologia, bioinformática e software movido por IA, que desenvolve soluções de próxima geração para genômica, saúde e ciências da vida. Somos especializados em análise d...
Sobre este Serviço
Ofereço análise personalizada de rna-seq de célula única adaptada ao seu conjunto de dados e objetivos de pesquisa. Cada projeto é ajustado à questão biológica, aplicando fluxos de trabalho reprodutíveis em R ou Python (Seurat, Scanpy, etc.) para entregar resultados de alta qualidade e interpretáveis.
Serviços incluem:
- Controle de qualidade e filtragem
- Normalização, escalonamento e redução de dimensionalidade (PCA, UMAP/t-SNE)
- Agrupamento e identificação de genes marcadores
- Annotação de tipo celular e enriquecimento de vias (opcional)
- Geração de visualizações prontas para publicação e relatórios resumidos
Com mais de quatro anos de experiência em bioinformática e múltiplas disciplinas de omicas, garanto que cada análise seja robusta, transparente e biologicamente significativa. Por favor, entre em contato comigo antes de fazer o pedido para discutir seus dados e objetivos de análise.
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Que tipo de dados posso fornecer?
Você pode fornecer arquivos FASTQ brutos (para processamento com Cell Ranger ou equivalente) ou matrizes de contagem processadas (por exemplo, .mtx, .h5 ou .csv). Vou adaptar o fluxo de trabalho de acordo com o tipo de dado e seus objetivos de projeto.
Você realiza processamento de dados brutos (FASTQ para matriz de contagem)?
Sim. Essa etapa pode ser adicionada como um serviço extra e inclui alinhamento de leitura, contagem de UMI e geração da matriz de expressão adequada para análises posteriores.
Quais ferramentas você usa para a análise?
Eu uso principalmente Seurat, Scanpy, Monocle3 e Cell Ranger, junto com pacotes padrão de R e Python para visualização e análise de enriquecimento.
Você consegue integrar múltiplas amostras ou lotes?
Sim. Correção de batch e integração de múltiplas amostras podem ser incluídas como um complemento. Eu uso Seurat v4, Harmony ou Scanorama, dependendo das características do conjunto de dados
Como podemos discutir a questão biológica ou o plano de análise?
Antes de começar, trocaremos algumas mensagens para definir seus principais objetivos e detalhes dos dados. Depois, confirmarei o melhor pacote ou sugerirei uma oferta personalizada, se necessário.
