Vou analisar dados de RNA seq de célula única usando R e Seurat

Você está trabalhando com dados de sequenciamento de RNA de célula única e precisa de ajuda com seu fluxo de trabalho do Seurat?

Eu ofereço uma análise de RNA-seq de célula única clara e reprodutível usando R e Seurat. Dependendo do pacote escolhido, posso ajudar com:

Controle de qualidade e filtragem de células

Normalização e seleção de recursos variáveis

PCA, UMAP, agrupamento e avaliação de efeito de lote

Análise de genes marcadores e expressão diferencial

Anotação básica de tipos de células usando marcadores conhecidos

Gráficos prontos para publicação como UMAP, violino, recurso, ponto e heatmap

Solução de problemas de objetos Seurat, ensaios, camadas e erros de análise

Você receberá código organizado em R, resultados da análise, figuras e uma explicação clara do fluxo de trabalho. Meu foco é em análise precisa, comunicação transparente e resultados que você possa entender e reproduzir.

Por favor, note: Você deve fornecer uma matriz de contagem, matriz de expressão processada ou objeto Seurat. O processamento bruto de FASTQ não está incluído. A anotação de células é baseada em marcadores disponíveis e informações de referência, devendo ser validada biologicamente.

Entre em contato comigo antes de fazer o pedido para discutir o tamanho dos seus dados, questão de pesquisa, entregáveis esperados e cronograma.