Vou fazer análise de rnaseq ngs desde reads brutos até expressão diferencial

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Farah Saleem

Paquistão

Eu falo Urdu, Inglês

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Onde a expertise em pesquisa encontra a excelência em escrita acadêmica

Sou bioinformata, pesquisadora e escritora acadêmica com expertise avançada em Python, C, C++ e desenvolvimento front-end (HTML, CSS, JavaScript, Bootstrap). Meu forte em ciência de dados, aprendizado...
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Sobre este Serviço

Eu ofereço análise de RNA-seq e NGS de ponta a ponta, desde as leituras brutas de sequenciamento até os resultados de expressão diferencial e visualizações prontas para publicação.

O que eu entrego:

  • Controle de qualidade e corte de leituras (FastQC, fastp)
  • Alinhamento/quantificação (Salmon)
  • Análise de expressão diferencial (DESeq2 em R)
  • Visualizações: gráficos de volcano, PCA, heatmaps
  • Análise de vias/enriquecimento (GO/KEGG) pacote premium
  • Modelagem preditiva baseada em IA nos dados de expressão pacote premium

Ferramentas: Python, R, Salmon, DESeq2, tximport, ggplot2

Se você precisa do pipeline completo ou ajuda com apenas uma etapa, por exemplo, você já tem uma matriz de contagens e só precisa de análise de expressão diferencial e gráficos, posso começar de onde seus dados estiverem atualmente.

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do rnaseq ngs analysis from raw reads to differential expression
Tela Inteira
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