Vou analisar dados de RNA seq usando deseq2, edger, go, kegg e pca

Procurando uma análise de RNA-seq rigorosa, pronta para publicação, e não um script que só gera um CSV?

Sou Dr. Faisal, biólogo molecular de plantas com doutorado e pesquisador pós-doutoral (Connecticut Agricultural Experiment Station, EUA), com mais de 35 publicações revisadas por pares e experiência prática em RNA-seq em mais de 20 espécies.

O QUE VOCÊ RECEBE:

QC (FastQC/MultiQC)

Trimagem e alinhamento (HISAT2/STAR ou kallisto/salmon)

Diferença de expressão (DESeq2/edgeR)

PCA, gráficos de vulcão, heatmaps

Análise de enriquecimento GO e vias KEGG

Interpretação biológica escrita

PARA QUEM É ISSO:

Estudantes de mestrado, pós-doutores e laboratórios com dados brutos FASTQ ou de contagem que precisam de uma análise correta, de nível de publicação, e não apenas números.

O QUE PRECISO DE VOCÊ:

Arquivos FASTQ, matriz de contagem ou acessos SRA

Design experimental (quais amostras pertencem a qual grupo)

Genoma de referência/especie

Me envie uma mensagem antes de fazer o pedido se seu conjunto de dados for grande ou de uma espécie não-modelo, assim posso fornecer um orçamento preciso.