Vou realizar simulações de MD de proteínas modificadas e complexos de ligantes
Professor Associado de Química Física
Sobre este Serviço
Ofereço simulações profissionais de dinâmica molecular (MD) usando Schrödinger Maestro (Desmond) para proteínas, complexos proteína-ligante e proteínas covalentemente modificadas. Meus serviços incluem preparação do sistema, configuração da simulação, execuções de MD de produção e análise completa das trajetórias (RMSD, RMSF, Raio de Gyração, SASA, ligações de hidrogênio, estrutura secundária e mais). Você receberá figuras de qualidade para publicação, arquivos de simulação e um relatório científico claro para apoiar sua pesquisa ou desenvolvimento de produto.
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Quais informações você precisa para iniciar o projeto?
Normalmente, preciso da estrutura da proteína (arquivo PDB ou ID do PDB), estrutura do ligante (se aplicável), detalhes de quaisquer modificações covalentes ou mutações, seus objetivos de pesquisa e o tempo desejado para a simulação. Se estiver em dúvida, posso ajudar a determinar a melhor configuração.
Você consegue simular proteínas quimicamente modificadas ou complexos covalentes de proteína–ligante?
Sim. Posso modelar proteínas covalentemente modificadas.
O que receberei no final do projeto?
Você receberá os arquivos de entrada e saída da simulação, arquivos de trajetória, gráficos de análise de qualidade para publicação (como RMSD, RMSF, Rg, SASA e estrutura secundária) e um relatório conciso explicando os resultados e comparando a estabilidade estrutural dos seus sistemas.
