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Vou realizar análise de bioinformática de dados de sequenciamento
Analista de Bioinformática e Coordenador de Pesquisa Clínica
Sou graduado em Mestrado em Bioinformática, profissional de saúde e Coordenador de Pesquisa Clínica, especializado em doenças infecciosas e pesquisa de microbioma. Apoio equipes acadêmicas transforman...
Sobre este Serviço
Ofereço suporte prático, reprodutível de bioinformática para projetos de pesquisa de sequenciamento e microbioma.
Posso ajudar com organização de metadados, verificações de amostras e IDs de execução, controle de qualidade FASTQ, corte de adaptadores e qualidade, relatórios MultiQC, remoção de host, perfil taxonômico, análise exploratória e relatórios claros prontos para pesquisa.
Você receberá saídas estruturadas adaptadas ao seu projeto, como arquivos de metadados limpos, relatórios de QC, tabelas de resumo, figuras e notebooks ou scripts reprodutíveis, quando incluídos no seu pacote.
Trabalho com arquivos Excel/CSV/TSV e dados de sequenciamento, usando Python, R, Linux, FastQC, MultiQC, fastp, KneadData, Bowtie2 e MetaPhlAn.
Por favor, forneça apenas dados desidentificados. Este serviço é destinado a fins de pesquisa e educação e não fornece diagnóstico clínico ou interpretação médica.
Para grandes conjuntos de dados, fluxos de trabalho personalizados ou perguntas específicas de pesquisa, entre em contato antes de fazer o pedido para confirmarmos o escopo e os entregáveis.
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Com que dados você pode trabalhar?
Posso trabalhar com arquivos de metadados de sequenciamento desidentificados em Excel, CSV, TSV, FASTQ. Por favor, entre em contato primeiro para BAM, VCF ou outros formatos.
O que vou receber?
Dependendo do pacote, você pode receber metadados limpos, relatórios de QC FASTQ, resumos MultiQC, leituras cortadas, tabelas taxonômicas, figuras, relatórios e código reprodutível.
Você processa arquivos FASTQ paired-end?
Sim. Posso realizar controle de qualidade e corte conservador para dados de sequenciamento paired-end ou single-end. Compartilhe a quantidade de arquivos e o tamanho total compactado antes de fazer o pedido.
Você pode analisar dados de microbioma?
Sim. Apoio fluxos de trabalho de pesquisa de microbioma e metagenômica, incluindo organização de metadados, QC, pré-processamento, perfil taxonômico e análise exploratória.
Você fornece interpretação clínica ou diagnóstico?
Não. Este Gig é apenas para fins de pesquisa e educação. Não forneço diagnóstico clínico, recomendações de tratamento ou interpretação médica.
Como devo compartilhar meus dados?
Por favor, forneça apenas arquivos desidentificados. Para grandes conjuntos de dados de sequenciamento, entre em contato antes de fazer o pedido para combinar um método seguro de transferência e escopo do projeto.
Você pode trabalhar com projetos grandes ou personalizados?
Sim. Grandes conjuntos de dados, desenhos de estudo complexos e fluxos de trabalho personalizados exigem uma oferta personalizada. Por favor, envie uma mensagem com sua pergunta de pesquisa, tipos de arquivo, número de amostras e tamanho total do arquivo.
