Farei aprendizado de máquina, docking e dinâmica molecular

Básico

Aprendizado de Máquina

Geração de dados de atividade de ligantes a partir do ChEMBL/PubChem

(máximo 3 bioensaios, até 1K ligantes)

Modelos tradicionais de aprendizado de máquina (Floresta Aleatória, regressão logística, boosting de gradiente, etc.)

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Padrão

Básico +

ADMET +

Docking Molecular

Seleção de alvo

Refinamento de estrutura 3D

AutoDock Vina para docking (dockings cegos)

(máximo 100 ligantes)

Pontuações de ligação, lista ordenada

Figuras profissionais (top três resultados, pose de docking)

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Premium

Padrão +

Rede Neural de Deep Learning +

Previsão de sítio de ligação

Modelagem por homologia

Docking molecular específico de sítio

(máximo 1000 ligantes)

Interações proteína-ligante 2D

Figuras profissionais (top três resultados, pose de docking, interações)

+

Simulações de dinâmica molecular (Gromacs)

Três complexos, duas réplicas de cada

Máximo 100K átomos (cada sistema)

Geração de entrada, minimização, equilíbrio NVT, equilíbrio NPT, execuções de produção

RMSD, RMSF, raio de gyração, ligações de hidrogênio, SASA

Energia livre de ligação (MM-PBSA/MM-GBSA)

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Por favor, solicite mais detalhes se necessário antes de fazer seu pedido.