Vou analisar seus dados de rnaseq em grande escala com figuras prontas para publicação

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Eu falo Turco, Inglês, Alemão, Espanhol

Especialista em bioinformática e cientista de dados

Especialista em bioinformática com PhD, com 8 anos entregando análises genômicas e pipelines automatizados para diagnósticos clínicos e pesquisa acadêmica. Ajudo pesquisadores e empresas de biotecnolo...

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Sobre este Serviço

Tem dificuldades com análise de RNA-seq? Eu transformo seus dados brutos de sequenciamento em resultados de qualidade para publicação.

O QUE VOCÊ RECEBE:

Relatórios de controle de qualidade (FastQC, MultiQC)

Análise de expressão diferencial (DESeq2 ou edgeR)

Gráfico volcano mostrando genes up/downregulados

Gráfico PCA com agrupamento de amostras

Heatmap dos principais genes diferencialmente expressos

Análise de enriquecimento de vias GO/KEGG

Arquivos CSV com todas as estatísticas e listas de genes

Seção de métodos escrita (pronta para seu artigo)

O QUE PRECISO DE VOCÊ:

- Arquivos FASTQ (ou números de acesso SRA)

- Informações das amostras (quais são controle vs tratamento)

- Nome do organismo (posso trabalhar com qualquer espécie com transcriptoma)

Uso ferramentas padrão do setor: Salmon/STAR para alinhamento, DESeq2/edgeR para estatísticas, clusterProfiler para análise de vias. Toda análise é totalmente reproduzível com código documentado.

EXPERIÊNCIA: RNA-seq multi-tecido (cérebro, fígado, rim, testículos, gordura) experimentos de séries temporais (resposta ao fotoperíodo) dados de baixa contagem e transcritos raros análise de variantes clínicas a partir de RNA-seq organismos não-modelo sem anotação.

Dúvidas? Me envie uma mensagem antes de fazer seu pedido. Ficarei feliz em discutir suas necessidades específicas e recomendar o pacote ideal!

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