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Farei análise de expressão diferencial de RNA seq em r com deseq2
Transformando dados biológicos em insights que podem ser usados
Sou especialista em pesquisa computacional, com graduação em Biotecnologia e formação de nível mestrado em Bioquímica Médica, com experiência em biostatística, bioinformática e modelagem molecular. Ap...
Sobre este Serviço
Sou um biólogo computacional com mestrado em Bioquímica Médica e experiência em pesquisa na A*STAR Singapura. Faço análise de RNA-seq para pesquisadores que têm os dados e precisam de alguém para interpretá-los.
O QUE VOCÊ RECEBE
- Análise de expressão diferencial com DESeq2, corretamente configurada para seu desenho experimental
- Figuras prontas para publicação em 300 dpi, nos formatos PNG e PDF
- Uma tabela de resultados que você pode colocar direto em um arquivo suplementar
- O script de análise, anotado, para que você ou seu laboratório possam reruná-lo
- Uma interpretação escrita, incluindo o que os dados NÃO suportam
POR QUE ESSE ÚLTIMO PONTO IMPORTA
Revisores perguntam por que você filtrou em um determinado limiar, se ajustou por batch e por que uma amostra foi excluída. Tudo que entrego é documentado para que você possa responder a essas perguntas.
VEJA O PADRÃO ANTES DE COMPRAR
Uma análise completa minha, com código, figuras e ressalvas, é pública:
github.com/kND-17/hgsoc-origin-rnaseq
O QUE PRECISO DE VOCÊ
Sua matriz de contagens (ou arquivos FASTQ), uma planilha de metadados das amostras e uma frase sobre o que você quer descobrir. Me envie uma mensagem antes de pedir se estiver em dúvida sobre qual pacote é o ideal, que eu direi com honestidade.
Domínio:
Outros
Especialidade:
Outros
Linguagem de programação:
Python
•
R
•
SQL
Ferramentas:
caderno Jupyter
•
Excel
Tecnologia:
Python
•
R
•
Pandas
•
RStudio
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Você consegue trabalhar com arquivos FASTQ brutos?
Sim, esse é o pacote Premium. Os pacotes Básico e Padrão assumem que você já tem uma matriz de contagens.
Meus dados são inéditos e confidenciais. Isso é um problema?
Não. Eu não compartilho dados de clientes nem reutilizo, e posso deletar após a entrega mediante solicitação.
Você será autor no artigo?
Somente se você quiser. Ser autor ou reconhecer é totalmente sua decisão e nunca é uma condição.
E se a análise não encontrar nada significativo?
Você ainda recebe a análise completa, as figuras e uma descrição honesta do que os dados mostram. Um resultado nulo também é um resultado, e não vou ajustar limiares para fabricar um.
Você consegue lidar com dados de célula única?
Não neste serviço. Me envie uma mensagem e eu te direi se posso ajudar ou indicar alguém que possa.
