Eu vou montar o genoma de cloroplasto e fazer análise comparativa

Sobre este serviço

Você está procurando um bioinformata profissional para cuidar dos seus dados de genômica de plantas? Eu sou especializado em Montagem do genoma de cloroplasto (Plastoma) e análise comparativa de genomas completa. Forneço resultados prontos para publicação com figuras de alta resolução, feitas sob medida para periódicos SCI.

O que ofereço neste serviço:

1. Montagem e Anotação do Genoma

• Montagem de novo: Montagem de genoma circular de alta qualidade a partir de leituras brutas de Illumina, PacBio ou Nanopore usando GetOrganelle ou NOVOPlasty.
• Anotação Precisa: Predição de genes (CDS, rRNA, tRNA) usando GeSeq/PGA com curadoria manual para garantir precisão.

2. Análise Comparativa de Genomas

• Análise de limites de IR: Contração e expansão de Repetições Invertidas (pontos de junção).
• Identificação de Repetições: SSRs (Repetições de Sequência Simples) e Repetições Longas.
• Diversidade de Nucleotídeos: Análise de janela deslizante para identificar regiões altamente divergentes (Pi).
• Pressão de Seleção: Cálculo de razões Ka/Ks para genes codificadores de proteínas.

3. Filogenia e Visualização

• Árvores Filogenéticas: Construção de árvores de Máxima Verossimilhança (ML) ou Bayesiana (BI) usando IQ-TREE ou MrBayes.
• Figuras Profissionais: Mapas circulares de alta resolução (OGDRAW), gráficos de sintonia e visualizações de alinhamento comparativo.