Farei análise de interação de docking molecular, gnina, autodock vina e pymol

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Doutor em Química, especialista em Quimificação e Análise

Química com doutorado e mais de 15 anos de experiência em pesquisa e ensino. Eu me especializo em conectar dados de laboratório experimental com fluxos de trabalho computacionais modernos. Minha expe...
Sobre este Serviço

Precisa de um docking molecular preciso, pronto para publicação, para sua pesquisa ou projeto de design de drogas? Ofereço serviços de química computacional usando AutoDock Vina e GNINA (pontuação com CNN de aprendizado profundo), combinados com perfil detalhado de interação.

O que eu ofereço:

  • Preparação de alvo e ligante: reparo de estrutura, atribuição de cargas, protonação em pH fisiológico e minimização de energia.
  • Docking molecular: otimização da caixa de grade (docking em sítio ativo ou cego) usando AutoDock Vina e GNINA para previsões de afinidade robustas (kcal/mol).
  • Perfil de interação: mapas 2D de alta resolução via BIOVIA Discovery Studio (pontes de hidrogênio, pi-stacking, pontes de sal) e visuais 3D com ray-tracing no PyMOL.

Entregáveis:

  • Arquivos do complexo dockado (.pdb, .pdbqt, .sdf)
  • Sessão do PyMOL totalmente editável (.pse)
  • Figuras de alta resolução, prontas para publicação, com mais de 300 DPI
  • Tabela resumo de energias de ligação e contatos de resíduos-chave

Por que me escolher?

  • Fluxos de trabalho metodologicamente rigorosos, padrão de revisão por pares
  • Especialização profunda em design de drogas assistido por computador (CADD)
  • Resposta rápida e suporte científico claro

Por favor, envie uma mensagem com seu PDB ID do alvo e estruturas de ligantes antes de fazer o pedido!


Tecnologia:

Excel

•

caderno Jupyter

•

MATLAB

Tipo de análise:

Análise Quantitativa

•

Análise Qualitativa

Especialidade:

Estatísticas

Linguagem de programação:

Python

•

R

•

SPSS

Ferramentas:

Stata

•

Google Colab

•

Microsoft Excel