Vou fazer análise de bulk rnaseq com expressão gênica diferencial, go, análise de vias

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Anasmunir

Itália

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Consultor Científico

Doutor em Bioengenharia. Bacharel em Biologia Molecular na universidade, trabalhou com Nanopartículas por um tempo, depois cultura de tecidos e posteriormente Organ-on-chip. Atualmente trabalha como P...
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Sobre este Serviço

Tem dados de RNA-seq e precisa de resultados claro e defensável?

Vou executar um pipeline de RNA-seq em lote totalmente reproduzível em R/Python e entregar figuras prontas para publicação com um relatório de interpretação especializado, para que você possa passar direto dos dados brutos para a próxima seção do seu manuscrito.

  • Controle de qualidade e verificação de design: revisão de metadados, validação de replicatas, detecção de outliers e PCA
  • Análise de expressão diferencial: DESeq2 ou edgeR com correção FDR (BenjaminiHochberg)
  • Figuras prontas para publicação: volcano, MA, PCA, heatmap agrupado, gráficos de pontos/bubbles de pathway
  • Enriquecimento funcional: GO (BP/MF/CC) ± KEGG/Reactome via g:Profiler ou clusterProfiler
  • Tabelas de dados organizadas: contagens normalizadas, valores estabilizados por variância e tabelas de DEG (CSV/XLSX)
  • Relatório detalhado: HTML ou PDF com métodos completos, parâmetros e interpretação em linguagem simples


O que preciso de você:

Opção A: arquivos FASTQ + planilha de amostras

Opção B: matriz de contagem bruta (genes × amostras) + planilha de amostras

Humano, rato, camundongo ou qualquer outro, é só avisar.


Por favor, note:

Os resultados são apenas para fins de pesquisa, nenhuma alegação clínica ou diagnóstica é feita. Todos os dados são tratados confidencialmente e não são compartilhados com terceiros.

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do bulk rnaseq analysis with differential gene expression, go, pathway analysis
Tela Inteira
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Tecnologia:

caderno Jupyter

•

RStudio

Tipo de análise:

Análise quantitativa

•

Análise qualitativa

+ 2

Especialidade:

Outros

Linguagem de programação:

Python

•

R

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